آموزش سلولی و مولکولی

16 October 2024 11:36

📚ساختمان پروتئین‌ها


💠1. ساختمان اول:
   این سطح شامل توالی خطی آمینواسیدها است که توسط پیوندهای پپتیدی به یکدیگر متصل شده‌اند. ترتیب دقیق آمینواسیدها در این سطح تعیین‌کننده ویژگی‌ها و عملکرد پروتئین است.

💠2. ساختمان دوم (ثانویه):
   در این سطح، زنجیره آمینواسیدی به صورت محلی شکل‌های منظمی ایجاد می‌کند.

🔰 مهم‌ترین آنها عبارتند از:

♨️ #آلفا_هلیکس (α-Helix): یک ساختار مارپیچی که توسط #پیوندهای_هیدروژنی بین آمینواسیدهای مجاور پایدار می‌شود.

♨️ #بتا_شیت (β-Sheet): ساختاری صاف و لایه‌ای که زنجیره‌ها به صورت موازی یا ضد موازی کنار هم قرار گرفته و پیوندهای هیدروژنی بین آنها برقرار می‌شود.
  
💠3. ساختمان سوم:
   این سطح شامل تا شدن و پیچ‌خوردگی کامل زنجیره پروتئینی است که منجر به ایجاد #ساختار_سه‌_بعدی_پروتئین می‌شود. این ساختار توسط تعاملات مختلفی از جمله پیوندهای دی‌سولفیدی، هیدروفوبی، یونی و پیوندهای هیدروژنی پایدار می‌شود. ساختار ثالثیه تعیین‌کننده عملکرد پروتئین است.

💠4. ساختمان چهارم:
   این سطح تنها در پروتئین‌های چند زیرواحدی دیده می‌شود. در این سطح، چندین زنجیره پلی‌پپتیدی (زیرواحدها) به صورت اختصاصی به یکدیگر متصل شده و یک پروتئین عملکردی واحد را تشکیل می‌دهند. نمونه‌ای از این ساختار، #هموگلوبین است که از چهار زیرواحد تشکیل شده است.


✔️این چهار سطح با هم تعیین می‌کنند که پروتئین چگونه تا می‌شود و چه عملکردی دارد.


#با_آموزش_سلولی_مولکولی_استاد_مالکی_همراه_باشید

🔬@Molecular_Cell_Point

آموزش سلولی و مولکولی

10 October 2024 10:24

📚🧬برای توضیح دقیق‌تر از مثال‌های زیر برای همولوگ، ارتولوگ و پارالوگ استفاده می‌کنیم:

🔸1. مثال همولوگ:
   ژن‌های هموگلوبین در انسان و سایر مهره‌داران #همولوگ هستند زیرا از یک ژن مشترک نیاکان تکامل یافته‌اند. این ژن‌ها به دلیل شباهت توالی و ساختار پروتئین، همولوگ محسوب می‌شوند.

🔹2. مثال ارتولوگ:
   ژن CYP1A1 که مسئول تولید آنزیمی است که در متابولیسم مواد شیمیایی نقش دارد، در گونه‌های مختلف مانند انسان و موش #ارتولوگ است. این ژن در هر دو گونه از یک ژن نیاکانی مشترک تکامل یافته و عملکرد مشابهی را در متابولیسم مواد سمی بر عهده دارد.

🔸3. مثال پارالوگ:
   در ژن‌های گلوبین (مانند هموگلوبین)، ژن‌های α-گلوبین و β-گلوبین #پارالوگ هستند. این دو ژن نتیجه تکثیر ژنی در نیاکان انسان هستند و در یک گونه (انسان) یافت می‌شوند، اما با وجود شباهت‌های توالی، نقش‌های متفاوتی را در انتقال اکسیژن در بدن ایفا می‌کنند.

🔰نتیجه گیری:

✔️ ژن‌های CYP1A1  در #انسان_و_موش_ارتولوگ هستند.

✔️ژن‌های α-گلوبین و β-گلوبین در #انسان_پارالوگ هستند.

✔️#تمام_این_ژن‌ها_همولوگ به یکدیگر هستند زیرا از ژن‌های نیاکانی مشترک تکامل یافته‌اند.


🔬@Molecular_Cell_Point

آموزش سلولی و مولکولی

07 October 2024 10:23

🖇تغییرات شیمیایی پروتئین‌ها

♻️تغییرات شیمیایی پروتئین ها، که به آنها اصلاحات پس از ترجمه یا تغییرات شیمیایی پروتئین (post-translational modifications) گفته می‌شود، نقش مهمی در عملکرد و فعالیت پروتئین‌ها دارند. این تغییرات پس از سنتز پروتئین در ریبوزوم‌ها صورت می‌گیرند و می‌توانند ساختار، عملکرد و محل پروتئین‌ها را تغییر دهند.

🔰برخی از مهم‌ترین تغییرات شیمیایی پروتئین‌ها عبارتند از:

🔸1. فسفریلاسیون (Phosphorylation): اضافه شدن گروه فسفات به اسیدهای آمینه خاصی مانند سرین، ترئونین و تیروزین. این فرآیند باعث فعال‌سازی یا غیرفعال‌سازی پروتئین‌ها (مانند آنزیم‌ها) می‌شود و نقش مهمی در سیگنالینگ سلولی دارد.

🔹2. گلیکوزیلاسیون (Glycosylation): اضافه شدن زنجیره‌های قندی به پروتئین‌ها که معمولاً در پروتئین‌های ترشحی و پروتئین‌های غشایی رخ می‌دهد. این فرآیند در تشکیل و عملکرد پروتئین‌های غشایی و همچنین در سیستم ایمنی نقش دارد.

🔸3. استیلاسیون (Acetylation): اضافه شدن گروه استیل به آمینواسید لیزین. این تغییرات بر روی کروماتین‌ها و هیستون‌ها می‌تواند ساختار ژن را تحت تأثیر قرار دهد و در تنظیم بیان ژن‌ها دخالت کند.

🔹4. متیلاسیون (Methylation): اضافه شدن گروه متیل به اسیدهای آمینه خاص، مانند لیزین و آرژینین. این تغییر در تنظیم بیان ژن و ساختار کروماتین نقش دارد.

🔸5. یوبیکویتیناسیون (Ubiquitination): اضافه شدن مولکول‌های یوبیکویتین به پروتئین‌ها که باعث علامت‌گذاری آنها برای تخریب در پروتئازوم می‌شود. این تغییر مهم است در تنظیم پروتئین‌های معیوب یا پروتئین‌هایی که دیگر به آنها نیاز نیست.

🔹6. هیدروکسیلاسیون (Hydroxylation): اضافه شدن گروه هیدروکسیل به پروتئین‌ها، که معمولاً بر روی پرولین و لیزین رخ می‌دهد و در تشکیل کلاژن اهمیت دارد.

🔸7. پروتئولیز (Proteolysis): تجزیه یا بریدن زنجیره‌های پروتئینی به قطعات کوچکتر توسط آنزیم‌های پروتئولیتیک. این فرآیند می‌تواند به فعال‌سازی پروتئین‌های خاصی مانند آنزیم‌ها یا هورمون‌ها منجر شود.

🔹8. لیپیداسیون (Lipidation): اتصال گروه‌های لیپیدی به پروتئین‌ها، که معمولاً باعث اتصال پروتئین‌ها به غشای سلولی می‌شود.

✔️این تغییرات شیمیایی برای تنظیم عملکرد، پایداری و محل قرارگیری پروتئین‌ها در سلول بسیار حیاتی هستند.

🔬@Molecular_Cell_Point

آموزش سلولی و مولکولی

06 October 2024 21:34

💫wait for better days to come...stay strong

🍂@Research_EducationChannel

آموزش سلولی و مولکولی

24 September 2024 23:27

🖌شروع ثبت نام صفر تا صد مقاله نویسی

📝مدرس : دکتر تقدسی ( سه سال سابقه تدریس پروپوزال نویسی و مقاله نویسی بصورت آنلاین ، دارای مقالات متعدد در ژورنال های داخلی و خارجی، سابقه همکاری با مجلات علوم پزشکی بعنوان داور و‌.... )

📝مدرس: دکتر خالدی (دارای مقالاتی متعدد بین المللی و...؛نوبسنده کتب متعدد علمی؛ داوری در ژورنال های متعدد بین المللی و داخلی و پژوهشگر برتر علوم پزشکی)

🔎 ویژه: علاقمندان و دانشجویان
کارشناسی، کارشناسی ارشد و دکترا در همه رشته های تحصیلی

🗓 مدت زمان دوره: یک ماه (شامل ارایه آموزش نوشتن پروپوزال؛ آموزش قسمت های مختلف پروپوزال؛‌ آموزش نوشتن مقاله ؛ آموزش قسمت های مختلف مقاله ؛ ارایه عنوان مقاله؛ آموزش انلاین؛ سابمیت مقاله : ارایه مقاله به ژورنال ؛ پیگیری و اخذ پذیرش نهایی مقاله در مجلات)

🗓 شروع دوره:

ثبت نام: جهت اطلاع و هماهنگی به آیدی زیر پیام دهید.
@mahtabmhbd

کانال و وب سایت ما رو دنبال کنید.🙏

/channel/Research_EducationChannel

https://felicity341.hocoos.com

آموزش سلولی و مولکولی

27 August 2024 13:02

🖌چهار مزیت اصلی NGS نسبت به ترتیب کلاسیک سانگر (Sanger) عبارتند از:

🔻اندازه ی نمونه
تکنیک NGS بطور قابل توجهی ارزان تر ، سریعتر ، به DNA به طور قابل توجهی كمتر نیاز دارد و از توالی Sanger دقیق تر و مطمئن تر است. بگذارید دقیق تر به این موضوع نگاه کنیم. برای توالی Sanger ، مقدار زیادی از  DNA الگوی برای هر خوانده شده مورد نیاز است. چندین رشته DNA الگوی لازم برای توالی هر پایه مورد نیاز است. در NGS ، یک توالی را می توان از یک رشته واحد بدست آورد. در هر دو نوع توالی ، چندین نسخه مبهم برای ساخت ساختار ها و اعتبار سنجی توالی گرفته شده است.

🔻سرعت
تکنیک NGS بطور قابل توجهی ارزان تر ، سریعتر ، به DNA به طور قابل توجهی كمتر نیاز دارد و از توالی Sanger دقیق تر و مطمئن تر است. بگذارید دقیق تر به این موضوع نگاه کنیم. برای توالی Sanger ، مقدار زیادی از  DNA الگوی برای هر خوانده شده مورد نیاز است. چندین رشته DNA الگوی لازم برای توالی هر پایه مورد نیاز است. در NGS ، یک توالی را می توان از یک رشته واحد بدست آورد. در هر دو نوع توالی ، چندین نسخه مبهم برای ساخت ساختار ها و اعتبار سنجی توالی گرفته شده است.

🔻هزینه
کاهش زمان ، نیروی انسانی و رجنتس در NGS به معنای پایین آمدن هزینه ها است. اولین هزینه پروژه توالی ژنوم انسانی 300 میلیون پوند است. با استفاده از روشهای نوین توالی Sanger ، به کمک داده های توالی شناخته شده ، ژنوم کامل انسانی هنوز 6 میلیون پوند هزینه دارد. توالی ژنوم انسانی با Illumina امروز کمتر از 1000 پوند خواهد بود.

🔻دقت
تکرارها برای NGS ذاتی هستند ، زیرا هر خوانده شده قبل از توالی تقویت می شود ، و به این دلیل که به بسیاری از خوانش های با هم همپوشانی کوتاهی دارند، بنابراین هر بخش DNA یا RNA چندین بار تعیین توالی می شوند. همچنین به دلیل اینکه خیلی سریعتر و ارزان تر است ، می توان تکرارهای بیشتری نسبت به توالی Sanger انجام داد. تکرار بیشتر به معنای پوشش بیشتر است ، که منجر به تعیین توالی دقیق تر و مطمئن تر می شود ، حتی اگر خواندن فردی برای NGS دقیق تر باشد.

🔬@Molecular_Cell_Point

آموزش سلولی و مولکولی

12 October 2024 14:15

💫احمقانه‌ترین خواستۀ بشر
این است که انتظار دارد
با تکرارِ روش‌های همیشگی‌اش
به نتایجِ متفاوت برسد...!

#آلبرت_انیشتین


🍂@Research_EducationChannel

آموزش سلولی و مولکولی

10 October 2024 10:12

⁉️همولوگ، ارتولوگ و پارالوگ

اینها اصطلاحاتی هستند که در زیست‌شناسی مولکولی برای توصیف روابط ژنتیکی بین ژن‌ها به کار می‌روند. این مفاهیم به #شباهت‌ها و #تفاوت‌های ژنی بین گونه‌ها یا درون یک گونه اشاره دارند.

1⃣ همولوگ (Homolog):
ژن‌های همولوگ، ژن‌هایی هستند که از یک ژن نیاکان مشترک تکامل یافته‌اند. این ژن‌ها می‌توانند بین گونه‌های مختلف یا درون یک گونه یافت شوند و در حالت کلی، #شباهت‌های_ساختاری و توالی دارند. همولوگ‌ها شامل ارتولوگ‌ها و پارالوگ‌ها می‌شوند.

2⃣ ارتولوگ (Ortholog):
ژن‌های ارتولوگ ژن‌هایی هستند که در نتیجه #تکامل_گونه‌ای (Speciation) از یک ژن مشترک در نیاکان، در گونه‌های مختلف به وجود آمده‌اند. این ژن‌ها معمولاً همان عملکرد یا نقش را در گونه‌های مختلف حفظ کرده‌اند. به طور مثال، ژن‌های ارتولوگ در انسان و موش که از یک ژن نیاکانی مشترک تکامل یافته‌اند، اغلب وظایف مشابهی در هر دو گونه دارند.

3⃣ پارالوگ (Paralog):
ژن‌های پارالوگ ژن‌هایی هستند که در نتیجه #تکثیر_ژنی (Gene Duplication) درون یک گونه ایجاد شده‌اند. این ژن‌ها معمولاً در یک گونه وجود دارند و ممکن است طی زمان تکامل عملکردهای متفاوت یا مشابهی را بر عهده گرفته باشند. به عنوان مثال، ژن‌های پارالوگ ممکن است یک مسیر بیوشیمیایی را در یک گونه کنترل کنند اما به مرور زمان وظایفشان تخصصی‌تر شده و نقش‌های متفاوتی ایفا کنند.

🔰 تفاوت‌های اصلی :

💢منشأ تکاملی: ژن‌های #ارتولوگ از یک ژن مشترک در نیاکان دو گونه مختلف تکامل یافته‌اند، در حالی که ژن‌های پارالوگ نتیجه تکثیر ژنی درون یک گونه هستند.

💢 عملکرد: ژن‌های #ارتولوگ اغلب عملکرد مشابهی در گونه‌های مختلف دارند، در حالی که ژن‌های پارالوگ ممکن است عملکردهای متفاوتی را درون یک گونه به عهده بگیرند.

🔬@Molecular_Cell_Point

آموزش سلولی و مولکولی

07 October 2024 10:07

⁉️ترکیب سلولی

🖇به طور کلی شامل مواد مختلفی است که هر یک درصد خاصی از وزن خشک یا مرطوب سلول را تشکیل می‌دهند.

🔻در زیر درصد تقریبی برخی از اجزای اصلی سلول آورده شده است:

✔️1. آب: حدود 70-80٪ از حجم سلول را تشکیل می‌دهد و مهمترین بخش سلول از نظر مقدار است.

✔️2. پروتئین‌ها: حدود 15-20٪ از وزن خشک سلول را تشکیل می‌دهند. پروتئین‌ها نقش‌های مختلفی از جمله ساختاردهی، آنزیمی و جابجایی مولکول‌ها را برعهده دارند.

✔️3. لیپیدها: حدود 2-5٪ از وزن خشک سلول را تشکیل می‌دهند. لیپیدها به ویژه در غشاهای سلولی و ذخیره انرژی نقش دارند.

✔️4. معمولاً DNA، حدود 1-6٪ از وزن خشک سلول را تشکیل می‌دهد و بیشتر در فرآیندهای مرتبط با سنتز پروتئین نقش دارد.

✔️5. نسبت RNA به DNA کمتر است و حدود 0.25٪ از وزن خشک سلول را تشکیل می‌دهد.

🔆این مقادیر به صورت تقریبی هستند و ممکن است در سلول‌های مختلف بسته به نوع و عملکردشان تفاوت داشته باشند.


#با_کانال_آموزش_سلولی_مولکولی_ما_همراه_باشید

🔬@Molecular_Cell_Point

آموزش سلولی و مولکولی

29 September 2024 13:06

🔵سلول‌ها به دو دسته اصلی پروکاریوت و یوکاریوت تقسیم می‌شوند. این تقسیم‌بندی بر اساس ساختار و ویژگی‌های سلولی آن‌ها انجام می‌شود.

✅1. پروکاریوت‌ها
پروکاریوت‌ها سلول‌های ساده‌ای هستند که فاقد هسته و اندامک‌های محصور شده هستند. اطلاعات ژنتیکی آن‌ها در ناحیه‌ای به نام نوکلئوتید قرار دارد.

💢ویژگی‌ها:
- اندازه کوچک (معمولاً ۰.۱ تا ۵ میکرون)
- عدم وجود هسته
- عدم وجود اندامک‌های محصور (مانند میتوکندری و آندروپلاسمیک)
- دیواره سلولی معمولاً از پپتیدوگلیکان تشکیل شده است.

🔸مثال‌ها:
- باکتری‌ها: مانند Escherichia coli و Staphylococcus aureus.
-آرکئا: مانند Methanogens و Halophiles.

✅2. یوکاریوت‌ها
یوکاریوت‌ها سلول‌های پیچیده‌تری هستند که دارای هسته و اندامک‌های محصور می‌باشند. اطلاعات ژنتیکی در هسته قرار دارد.

💢ویژگی‌ها:
- اندازه بزرگتر (معمولاً ۱۰ تا ۱۰۰ میکرون)
- وجود هسته و اندامک‌های مختلف (مانند میتوکندری، گُلژی، و ریبوزوم)
- ممکن است دیواره سلولی داشته باشند (مانند در گیاهان و قارچ‌ها).

🔸مثال‌ها:
- سلول‌های گیاهی: مانند سلول‌های برگ گیاهان.
- سلول‌های جانوری: مانند سلول‌های انسانی و سلول‌های موجودات دیگر.
- قارچ‌ها: مانند Saccharomyces cerevisiae (مخمر).

✔️ جمع‌بندی
به طور کلی، پروکاریوت‌ها ساختار ساده‌تری دارند و بیشتر به عنوان میکروارگانیسم‌ها شناخته می‌شوند، در حالی که یوکاریوت‌ها شامل موجودات پیچیده‌تر از جمله گیاهان، جانوران، و قارچ‌ها هستند.

🔬@Molecular_Cell_Point

آموزش سلولی و مولکولی

06 September 2024 15:13

⁉️در قرون وسطی بیماری طاعون آغازگر رنسانس یا دگر اندیشی در اروپا بود. تا قبل از شیوع طاعون عوام فکر میکردند که کلیسا و کشیشان شفابخش هستند! اما پس از شیوع طاعون مردم با چشمان خود دیدند که پاشیدن آب مقدس توسط کشیش روی بیمار باعث شفای او نشد، بلکه خود کشیش هم طاعون گرفت و مرد...

🚫کلیسا دست به هرکاری زد تا طاعون را از بین ببرد، از آتش زدن گربه‌ها گرفته تا کشتن یهودیان و ... اما طاعون از بین نرفت! این موضوع یکی از عوامل اصلی دور شدن مردم از خرافات و توهمات و ایجاد رنسانس در اروپای پانصد سال قبل بود...

🍃@Research_EducationChannel

آموزش سلولی و مولکولی

27 August 2024 12:47

🔎فناوری NGS چیست؟!

💢توالی یابی DNA، فرآیند تعیین توالی نوکلئوتیدها در یک بخش از DNA است . اولین روش تجاری سازی توالی DNA توالی Sanger بود. ترتیب توالی نسل بعدی (NGS) ، همچنین به عنوان توالی بالا با توان شناخته می شود ، اصطلاح گیرنده ای است که برای توصیف تعدادی از فن آوری های مختلف ترتیب بندی مدرن استفاده می شود . این فناوری‌ها باعث می شوند تعیین توالی DNA و RNA بسیار سریعتر و ارزانتر از توالی Sanger که قبلاً استفاده شده بود ، انجام شود و به همین ترتیب مطالعه ژنومیک و زیست شناسی مولکولی را تغییر داده است.

💢چنین فناوری هایی عبارتند از:

✅ترتیب توالی Illumina (Solexa)
توالی Illumina با شناسایی همزمان پایه های DNA کار می کند ، زیرا هر پایه یک سیگنال فلورسنت منحصر به فرد ساطع می کند و آنها را به زنجیره اسید نوکلئیک اضافه می کند.

✅توالی Roche 454
این روش مبتنی بر پیروسكنسینگ است ، روشی كه رهاسازی پیرو فسفات را تشخیص می دهد ، مجدداً با استفاده از فلورسانس ، پس از آنكه نوكلوتیدها توسط پلیمراز به رشته جدیدی از DNA تبدیل می شوند.

✅یون تورنت: تعیین توالی پروتون PGM/
توالی یون تورنت آزادسازی مستقیم H + (پروتون ها) از ترکیب پایگاه های انفرادی توسط DNA پلیمراز را اندازه گیری می کند و بنابراین اندازه گیری نور با دو روش قبلی متفاوت است.


🔬@Molecular_Cell_Point