💻 Вакансия дня: биоинформатик с опытом анализа WES/WGS

В Центр системной биоинформатики (структурное подразделение Томского НИМЦ РАН) требуется специалист по анализу данных полногеномного и полноэкзомного секвенирования, включая данные длинных прочтений LR-WGS, полученных в рамках национальной генетической инициативы «100 000+Я».

Предстоит обработка и интерпретация ~1000 экзомов и полных геномов, интеграция мультиомиксных данных для решения задач цитогенетики/геномики, популяционной и медицинской генетики.

Обязанности:

• базовый и продвинутый анализ данных WES/WGS и LR-WGS, работа в рамках проектов по поиску патогенетически и клинически значимых генетических, хромосомных и эпигенетических вариантов, выявление и интерпретация структурных вариантов, хромосомных перестроек и сложных геномных событий
• разработка/применение алгоритмов и инструментов для мультиомиксного анализа, интеграция WES/WGS и LR-WGS с клиническими, цитогенетическими и эпигеномными данными
• создание, оптимизация и сопровождение воспроизводимых аналитических пайплайнов, автоматизация анализа, написание скриптов на Bash, Python, R, работа с вычислительной инфраструктурой
• предоставление результатов в виде инфографики и отчетов, участие в подготовке публикаций и докладов

Требования:

➤ владение инструментами анализа данных WES/WGS (выравнивание, вариант-коллинг, фильтрация и аннотация вариантов)
➤ понимание принципов выявления структурных вариантов, CNV и хромосомных перестроек
➤ опыт работы с Linux, командной строкой и навыки написания скриптов (Bash, Python и/или R)
➤ чтение научной литературы и технической документации на английском
➤ будет преимуществом опыт работы с LR-WGS, эпигеномными данными и выявления структурных вариантов

Условия:

• очная работа, график 5/2
• полностью оборудованное индивидуальное рабочее место
• современный мощный компьютер, доступ к вычислительной инфраструктуре и системе хранения данных

↗️ Зарплата: 115 000–130 000 ₽ / мес (до вычета налогов). Возможность дополнительного дохода при участии в научно-исследовательских работах и грантах.

🛫 Узнать подробности и откликнуться: blastim.ru/job/15771/

#бластим_вакансии

Читать полностью…

🧲 Магнитогенетика: надеваем шапочки из фольги?

Друзья, 6 мая в 18:00 мск неожиданно приглашаем вас на лекцию по магнитогенетике «В потоке электромагнитных полей: могут ли живые организмы чувствовать электромагнитное поле и станет ли это основой для технологий будущего?».

Лектор — Илья Зубарев, к.б.н., основатель и CTO биотехнологического стартапа ExoMe, эксперт в области клеточной биологии, внутриклеточного сигналинга и морфогенеза тканей.

Магнитогенетика — направление, изучающее возможность управления активностью клеток с помощью магнитного поля. На лекции узнаем, что чувствует человек в аппарате МРТ, за счет чего осуществляется магниторецепция у бактерий и других организмов, можно ли включать/выключать сигнальные пути воздействием поля и как эти знания помогут в биомедицине будущего — в том числе в попытках создать клетки человека, способные к биоминерализации магнитных наночастиц.

🗓️ Онлайн 6 мая в 18:00 мск

🤖 Для участия можете зарегистрироваться в Telegram боте: ссылка

🔗Или на нашем сайте: ссылка

Отличных майских выходных и до встречи на лекции!

Читать полностью…

В одной семье родился первенец. В годик малышу поставили тяжелый диагноз — анемия Фанкони. Это редкое наследственное заболевание, характеризующееся пороками развития, поражением костного мозга, повышенным риском рака. В 3 года 9 месяцев у мальчика нашли медуллобластому. Несмотря на все усилия врачей, не дожив два месяца до пятилетия, ребенок скончался. Ужасное, невыносимое горе для родителей.

Спустя время пара снова решилась на беременность. Чтобы предотвратить повторное рождение больного ребенка, семья согласилась сделать преимплантационное генетическое тестирование на моногенное заболевание (ПГТ-М). Это скрининг эмбрионов в процедуре ЭКО с помощью индивидуальной тест-системы. Но чтобы разработать тест, необходимо знать точные генетические причины недуга.

К анемии Фанкони приводят мутации в двадцати с лишним генах, связанных с репарацией. Наследование — аутосомно-рецессивное. Поэтому предстояло определить патогенные варианты, причем у обоих супругов. Секвенирование полного экзома быстро выявило у мамы мутацию в гене PALB2 (c.172_175del) — это был уже описанный в литературе фреймшифт.

Однако у папы ДНК-диагностика не обнаружила ничего, за что можно было зацепиться. Ни WES, ни MLPA, ни предпринятое ресеквенирование каждого экзона не помогли. Неужели тупик? Ученые сделали ход конем. Они обратили взор на структуру РНК. Разделили транскрипт гена PALB2 на 6 перекрывающихся локусов, провели ПЦР с обратной транскрипцией, профорезили ПЦР-продукты вместе с контрольными образцами. И заметили: участок, покрывающий 10–12 экзоны, укорочен по сравнению с диким типом. Оказалось, что у отца отсутствует 11 экзон. Прочитав ДНК этого локуса методом Сэнгера, ученые обнаружили небольшую делецию в 10 интроне (c.3114-16_3114-11del). Похоже, что именно она приводила к нарушению канонического акцепторного сайта сплайсинга и пропуску экзона (exon skipping). Для верификации эффекта делеции специалисты трансфицировали клетки линии HEK293T плазмидами, экспрессирующими миниген. Функциональный анализ подтвердил: перед нами патогенный вариант.

Титанический труд генетиков и биоинформатиков окупился: удалось создать тест-систему на оба варианта в гене PALB2. Семья успешно прошла ЭКО с ПГТ-М. В лаборатории проверили десять эмбрионов: три оказались компаунд-гетерозиготами, еще пять — несли либо мамину, либо папину мутацию, но нашлись два без генетических дефектов. В результате на свет появилась здоровая девочка!

Take-home message. NGS не всесилен, а полагаться на одни алгоритмы нельзя. Интронные варианты, «слепота» программ коллинга, неоднозначности при оценке патогенности запросто спутывают все карты медгенетикам. Только поиск исходя из фенотипа пациента, прокачанная клиническая логика и привлечение дополнительных методов позволяют справляться с кейсами, которые не укладываются в стандартные шаблоны.

Читать полностью…

⭕️ Что если всего за неделю можно собрать проект, который изменит ваше портфолио?

Наши друзья из Научной школы АльметТех приглашают студентов на весенний интенсив, где знания сразу проверяются практикой и превращаются в реальные решения.

📌 Когда: 13–18 мая
📍 Где: Альметьевск, Республика Татарстан
✏️ Прием заявок до 1 мая

Научная школа собрала актуальные задачи, с которыми сегодня работают в науке и индустрии. Это хороший способ усилить себя для следующих шагов: магистратуры, стажировок и собственных проектов. Реализация выбранных задач проходит в команде вместе с наставником.

Проживание, питание и программа уже организованы, а вам осталось выбрать понравившийся кейс!

#бластим_рекомендует

Читать полностью…

1986 год. Женщина под 50 проходит медосмотр. У нее диагностируют аденокарциному эндометрия. Новообразование успешно удаляют. Но злой рок рак преследует ее: в 2000 году у женщины находят рак молочной железы, в 2004 — две карциномы толстой кишки, а потом еще три опухоли в 2014 и 2016. Звучит как завязка мистического медицинского сериала Дэвида Линча? Всё куда прозаичнее, потому что это... синдром Линча!

🧬 Синдром Линча (нет, назван не в честь великого режиссера) — один из самых распространенных наследственных опухолевых синдромов. Такие раки — фактически обычные менделевские болезни. Герминальные мутации в определенных генах практически гарантируют патологию. Наследственные опухоли составляют 5–10% от всех раков и характеризуются ранней манифестацией. Классикой для объяснения механизма их появления стала двухударная теория Кнудсона: от одного родителя передается дефектный аллель, а потом в течение жизни инактивируется вторая копия.

Синдром Линча обусловлен мутациями в генах системы коррекции неспаренных оснований MMR. Это приводит к повышению частоты ошибок после репликации и геномной нестабильности. Что выливается в колоректальный рак, хотя поражаются и другие органы, особенно слизистая оболочка матки.

🎞 Наша героиня — пример марафонской стойкости и редкий клинический случай. За три десятилетия у пациентки обнаружили семь злокачественных неоплазм. Онкологи ее лечили, но не могли нащупать единую нить, связывающую эпизоды. Только в 2022–2023 гг. группа специалистов провела полноэкзомное секвенирование образцов крови и описала ранее неизвестную герминальную нонсенс-замену (c.484G>T) в гене мисматч-репарации MSH6, доказав ее вредоносность. Далее были изучены сохранившиеся в архивах парафиновые срезы тканей пяти карцином. С геномными данными на руках ученые, словно детективы, строили логические цепочки и сопоставляли мутационные профили опухолей. В итоге они установили, что множественные очаги — не метастазы, а независимые образования с индивидуальными соматическими вариантами! Часть опухолей развилась по Кнудсону и характеризовалась типичной микросателлитной нестабильностью, другие же можно было принять за спорадический рак, если не знать о синдроме Линча.

🕵🏻‍♂️ Отметим важную улику. Родители женщины ушли из жизни в 52 года: отец — от рака кишечника, мать — от рака груди. Сегодня подобный отягощенный семейный анамнез — очевидное показание к направлению на NGS. У диагностированных пациентов с множественными первичными очагами секвенирование позволяет выявить патогенную мутацию и персонализировать терапию, у здоровых людей — определить возможное носительство и назначить скрининг.

В 2021 году в возрасте 84 лет пациентка умерла. Однако не от онкологии, а от коронавируса. У нее остались наследники, которым передалась мутация в гене MSH6. Но благодаря ДНК-диагностике родственники осведомлены о рисках и получили рекомендации по дальнейшему наблюдению заболевания 👀

***
В исследовании уникального кейса принимала участие Дарья Николаевна Хмелькова, заместитель генерального директора Genetico по направлению Онкогенетика и преподаватель курса Бластим «NGS в наследственных заболеваниях», который начинается уже 18 мая. Приходите! Медгенетика — Твин Пикс каждый день

#выходные_у_бластим

Читать полностью…

🧪🧠 Друзья, зовем на новую встречу клуба «Цифровая медицина» – обсудим «умные» решения для лабораторной диагностики, которые превращают чекап в data science детектив.

Пока омиксные технологии открывают нам тысячи новых биомаркеров, требуя все больше пробирок с образцами, ИИ учится читать между строк – чтобы находить невидимые связи и скрытые корреляции, которые прячутся за цифрами в бланках анализов. Иногда – самых обычных, которые почти все мы сдаем регулярно во время чекапов.

🗓 Когда и где:
29 апреля, 16-00 мск, ОНЛАЙН

⚫️Как ИИ сегодня расширяет возможности «мокрой» лаборатории и привычных тестов?
⚫️Как отыскать и извлечь незримое из массива биомаркеров и омиксных данных?
⚫️Как валидировать результат и убедить клинику, врача и Росздравнадзор?
⚫️Как ИИ в in vitro помогает в ранней диагностике заболеваний, и сколько это может сэкономить в масштабах системы здравоохранения?
⚫️И главное – как внедрять такие решения в реальную медицинскую практику?

Все это обсудим с нашими спикерами – разработчиками собственных уникальных решений для диагностики на стыке ИИ, in vitro и биотеха:

🎤 Светлана Апполонова, к.х.н., руководитель Центра биофармацевтического анализа и метаболомных исследований, доцент кафедры фармакологии Института фармации имени А.П. Нелюбина Сеченовского Университета:

⚡️ О скрининг-платформе «Метабоскан», объединившей технологии метаболомики и ИИ, которая анализирует сотни метаболитов в крови, выявляет ранние сдвиги в обмене веществ и предсказывает риски развития хронических заболеваний, включая онкологические, ССЗ и сахарный диабет.

🎤Любовь Станкевич, к.м.н, врач КЛД, директор по лабораторной медицине и производству компании «ЛабКвест», доцент кафедры клинической лабораторной диагностики, медицинской микробиологии и патологической анатомии Академии последипломного образования ФГБУ ФНКЦ ФМБА России, вице-президент Российской ассоциации медицинской лабораторной диагностики (РАМЛД):

⚡️ О том, как устроена инновационная СППВР «ЛабКвест» на базе ИИ/ML, которая объединяет клиники и лабораторную службу в единую экосистему, позволяя улучшать эффективность диагностики in vitro, выявлять скрытые тренды и оценивать биомаркеры комплексно.

🎤 Ринат Гимадиев, генеральный директор «ЛАБХАБ», врач КЛД, заведующий клинико-диагностической лабораторией, научный сотрудник ГНЦ РФ ИМБП РАН, автор >70 научных работ, руководитель проекта:

⚡️ Об ИИ-платформе предиктивной аналитики «ЛабЧекап» для массового скрининга, которая предсказывает уровни «плохого» холестерина, HbA1, ферритина и других важных биомаркеров на основе рутинных анализов диспансеризации.

🎤 Наталья Подсосонная, заместитель директора Центра био- и медицинских технологий Сколтеха:

⚡️ О первой в мире системе омиксной диагностики для скрининга ментального здоровья NeurOmix, которая позволяет выявлять риски психоэмоциональных заболеваний, таких как шизофрения, депрессия, тревожные расстройства, ПТСР и БАР, по липидному профилю крови.

❗️Регистрация обязательна: https://leader-id.ru/events/602839

#invitro #ИИ #превентивнаямедицина #мультиомика #метаболомика #медтех #биотех

Читать полностью…

Биоинформатики, а вот вас сегодня не приглашаем!

Всем бластимовцам, должно быть, оскомину набила аббревиатура NGS, которую сразу же окружает ореол заумных слов: выравнивание, тримминг, преобразование Барроуза-Уилера... Но сегодня мы посмотрим на секвенирование нового поколения другими глазами. Со стороны тех, кто сталкивается с технологией в практической медицине — когда в очереди за дверью стоят реальные пациенты. Оторвемся от скриптов и пайплайнов и включим клинический мозг!

Эксперты ЦГРМ «Генетико» разберут применение секвенирования для диагностики моногенных болезней, скажут про NGS в онкогенетике, затронут генную и таргетную терапию, неонатальный скрининг и многое другое.

Почему стоит присоединиться:

• Всем зарегистрировавшимся отправим конспект и запись встречи
• Возможность задать свой вопрос и получить ответ от специалистов

🗓 Спешите: сегодня в 19:15 мск

🔗 Регистрация: https://s.salebot.pro/ngs

P.S. Будем рады всем интересующимся медгенетикой. Про биоинформатиков мы, конечно, пошутили. Тоже приходите!

Читать полностью…

Учись, пока не запретили

В наш век блокировок и ограничений никого ничем не удивишь. Но бывают исключения. В феврале 2026 года в РФ приняли закон № 43-ФЗ, запрещающий передачу данных, полученных в популяционных генетических и иммунологических исследованиях россиян, за границу. Популяцией при этом считается группа более трех человек. Документ вступает в силу 1 сентября.

В сообществе беспокоятся, что закон приведет к проблемам с поиском доноров костного мозга, закрытию отечественных баз популяционных частот (мы уже писали об их важности), сложностям с публикацией статей о выявленных вариантах, связанных с болезнями, и другим последствиям. Однако как строго всё будет соблюдаться в жизни, неясно.

В общем, в генетике опять грядут нелегкие времена. На этом фоне Бластим организовал курс по NGS в медицине. Что мы думаем по поводу новых правил? Мы убеждены, что никакие законы не должны затруднять доступ к ценной информации врачам и ученым, которые спасают жизни, особенно детей с наследственными заболеваниями.

И заодно развеем опасения: на занятиях нашей программы преподаватели НЕ работают с реальными пациентскими данными. У нас будут симуляционные/обезличенные кейсы и практика с международными ресурсами — без юридических рисков. Если есть потребность подробнее обсудить тему с экспертами Genetico, то ждем вас с вопросами в четверг на встрече.

И приходите учиться на курс в мае! Пока разрешено, пока открыто, пока преподаватели готовы делиться своим богатым опытом и наработками. У нас безопасно и можно подключаться из любой точки мира: https://agency.blastim.ru/ngs_genome

Читать полностью…

В мечтаниях, рождавшихся при свете лампы под зеленым колпаком, возник громадный университетский город

Друзья, давайте сегодня заглянем под абажур и узнаем всё изнутри о Факультете биоинженерии и биоинформатики.

В программе дня открытых дверей:
📌 выступление и. о. декана Андрея Замятнина
📌 презентация программ специалитета и магистратуры
📌 рассказ студента Кирилла Прокаповича о реальной студенческой жизни
📌 всё про обучении в магистратуре «Машинное обучение в биологии» от аспиранта и преподавателя ФББ Арсения Зинкевича

Информационная сессия начнется совсем скоро, в 13:30 мск

🔗Подключиться можно по ссылке в боте: https://s.salebot.pro/fbbmsu_1

❗️Если у вас не работает ссылка, то попробуйте открыть бота @fbbmsu_bot и написать там команду /start

Там же вы найдете небольшой профориентационный тест и получите рекомендацию о подходящей для вас программе магистратуры

🔑 P.S. Наши отцы-основатели окончили ФББ в 2012 году, мы недавно рассказали об этом здесь

Читать полностью…

Друзья, мы создали такую штуку, которая ищет гранты, инвесторов и спонсоров для научных проектов по всему миру. Естественно, задействован AI. Приходите в воскресенье, расскажем, как она работает.

У нас здесь масштабный план. Мы поможем ученым найти деньги, а учёные помогут нам оценить работу фондов.

Ну, в самом деле, почему оценки каждый раз получает тот, кто просит деньги, а не тот кто их распределяет?

А может фонд делает что-то некорректно и надо подсказать ему, как сделать лучше? Ну, или не ему, а тем, кто дает деньги фонду. Мы хотим, внедрить систему оценок грантодателям. Например, хорошо ли они проводят ревью заявок?

Но, главная цель проекта: чтобы деньги на науку было находить проще. А иначе зачем тогда искусственный интеллект, если он не помогает жить?

Юрий Потешкин, 19 апреля, 20:00 мск. Семинар/презентация/лекция — всё в одном. https://us06web.zoom.us/j/87647329442?pwd=5YtZDUJbh62MBH25JIxDwbOmcYaeKx.1

Читать полностью…

🍀 Вакансия дня: Клеточный биолог

Стартап в области косметики нового поколения, создающий продукты на основе внеклеточных везикул, ищет клеточного биолога для работы в лаборатории и участия в разработке продукта.

Чем предстоит заниматься:

• Культивирование клеток и ведение клеточных культур
• Выделение внеклеточных везикул
• Контроль качества клеточного материала и внеклеточных везикул
• Проведение молекулярно-биологических и биохимических анализов
• Работа с методами ПЦР и вестерн-блоттинга
• Ведение лабораторной документации и протоколов
• Участие в оптимизации лабораторных процессов и методик

Требования:

➤ Высшее образование в области клеточной биологии, биотехнологии, молекулярной биологии, биохимии или смежных направлений
➤ Практический опыт работы с клеточными культурами
➤ Опыт выделения и анализа внеклеточных везикул (будет преимуществом)
➤ Владение методами ПЦР и вестерн-блоттинга
➤ Опыт контроля качества биологического материала
➤ Аккуратность, ответственность, умение работать в лабораторном режиме

🛫 Зарплатная вилка: 100 000 – 150 000₽

✉️ Отклик: Biolab.tatiana@gmail.com

Подробнее на нашем сайте: https://blastim.ru/job/15755/

#бластим_вакансии

Читать полностью…

Карьера без BLATа*

В далеком 2012 году Вита Степанова и Юрий Пеков окончили факультет биоинженерии и биоинформатики МГУ. И практически сразу выяснили: диплом престижного вуза не сулит заоблачных перспектив. Но друзья не унывали и настойчиво искали свое место в биотехе.

В апреле 2015 года ребята сверстали простенький сайт, где поначалу буквально перепубликовывали вакансии с научных форумов. Через год туда подтянулись работодатели и сами стали выкладывать объявления, а потом и просить помочь с наймом кадров.

В то же время Юра и Вита продолжали вариться в науке и образовании. С благословения Михаила Сергеевича Гельфанда они запустили первый в стране интенсив по анализу NGS. Ребятам и самим было любопытно освоить модную технологию. Лекторов пригласили в основном из ФББ МГУ, а участники набрались из посетителей сайта. Так зарождался тот Бластим, который мы знаем сейчас, — агентство, объединяющее рекрутинг, курсы и другие активности в биотехе. Платформа, возникшая во многом из-за непонимания, что вообще происходит, и попыток разобраться.

Постепенно Юра и Вита осознали, что не хотят заниматься чистой наукой. Они пошли дотягивать бизнес-навыки, которым не учили в вузе. Фактически нашим героям пришлось самим прокладывать путь и изобретать велосипед. А изменилось ли что-то с тех пор?

Недавно в альма-матер Юры и Виты открылись четыре новые магистерские программы. Видимо, ФББ наконец-то ощутил боль своих бывших студентов. Концепция этих магистратур в том, что выпускники не чувствуют себя выброшенными из гнезда птенцами. Программы ФББ предполагают после защиты диплома бесшовный переход в биотех-, биомед-, фармкомпании. И не стажерами, а сразу на уровне мидла.

Направления такие:

• Управление высокотехнологичными проектами в сфере биоинженерии и фармацевтики
• Применение машинного обучения в биологии
• Производство лекарственных средств
• Фармацевтическая разработка

Подробнее о магах узнаем в воскресенье, 19 апреля, на онлайн-ДОДе. Бластим тоже планирует подключиться послушать: https://s.salebot.pro/fbbmsu_1 Приглашаем всех, кто сейчас на последних курсах и строит свой карьерный трек!

*BLAT (BLAST-like alignment tool) — это алгоритм выравнивания последовательностей, а вы что подумали?

Читать полностью…

С небес на землю: отвечаем на ваши комментарии

Когда на прошлой неделе мы разразились серией (1, 2, 3) постов про Claude Code и вовсю вайбкодящих зарубежных ученых, подписчица во ВК справедливо спросила, а есть ли примеры отечественных специалистов?

И, честно сказать, мы долго думали и наконец поняли: «Похоже, пионерами станете вы, друзья. Первыми оседлаете Claude Code для науки и автоматизируете решение своих задач, сведя к минимуму программирование руками».

Откуда такая уверенность? Потому что Бластим уже приложил к этому максимум усилий. А именно: наши преподаватели согласились добавить модуль про Claude Code в программу летнего потока курса «ИИ в научной работе»! Зачем вообще кодинговые агенты? Чем инструмент Anthropic лучше аналогов? Как всё установить и настроить, находясь в РФ? Как использовать Claude Code и не платить за токены? На занятиях досконально научимся работать с популярным и полезным тулом.

Раскроем детали ближе к старту 2 июня, но вы можете занять место на самом часто обновляющемся курсе Бластим уже сейчас: https://agency.blastim.ru/scientist_of_the_future 🤖

Читать полностью…

«Не NGS-ом единым: спектр методов в медицинской генетике»

Планируем пятницу уже в понедельник 🗓
17 апреля в 19:00 — забивайте слот в календаре для встречи с Бластимом!

Как сегодня выстраивается диагностическая воронка в медицинской практике? На вебинаре разберем путь от цитогенетики до NGS и подробно обсудим:
• что скрывается за аббревиатурами FISH, aCGH, CMA, MLPA, WES, WGS
• чем отличаются технологии по разрешающей способности
• сильные и слабые стороны каждого подхода
• в каких случаях достаточно кариотипирования, а когда нужен полный экзом

А может вообще можно обойтись без молекулярно-генетических методов? Спойлер: да.

💬 Обязательно готовьте свои вопросы. Спикеры будут щедро делиться практическими кейсами и опытом.

Обещаем, что будет полезно не только медикам, но и всем, кому небезразличны современные достижения генетики.

🔗 Регистрация по ссылке: https://s.salebot.pro/ngs170426_1

Читать полностью…

Знаете, я и сам своего рода психолог ©Бластим

Друзья, и снова суббота, и снова мы вместе с Факультетом фундаментальной медицины МНОИ МГУ имени М.В. Ломоносова. Но это не День Бластима 2.0 — на сей раз коллеги пригласили нас на PSYFEST!

Мы полистали программу мероприятия, и ноги сами понесли нас на день психопросвещения. Интерактивные семинары и тренинги, арт-терапия и индивидуальные консультации у психологов, психиатров и психотерапевтов. Почему дедлайны парализуют, а не мотивируют? Где грань между плохим настроением и расстройством? Как преодолеть стресс в сессию? Поверьте, сотрудникам Бластима такие темы тоже очень актуальны 😅

А еще по секрету: психология — альтер эго Бластима. Во-первых, наш легендаRный курс по статистике ведет междисциплинарная дрим-тим, костяк которой составляют выпускники психфака. Команда и сформировалась, когда Иван Поздняков, будучи преподавателем статистики для когнитивных психологов и психофизиологов в Вышке, прочитал курс для Бластима и потом забрал с собой всех, кто ему помогал. Куратор и лектор программы Елена Рыбина, а также крутые учебные ассистенты Михаил Решетников и Григорий Ануфриев — все они, как сами говорят, из одного «когнитивного гнезда» 🐥 Сейчас ребята больше шарят за датасайенс и IT, но не забывают о своих истоках. Да и на занятиях курса у нас никогда нет отбоя от слушателей из гуманитарных направлений.

Во-вторых, сооснователь и гендиректор Бластима Вита Степанова, еще до того, как поступить на ФББ и стать биоинформатиком, страстно хотела заниматься психологией и даже успела поучиться на психфаке! Подробности в видео

Ну а мы еще раз благодарим коллег из ФФМ МНОИ МГУ, что позвали нас на ивент и вдохновили на пост 💓

Гештальт закрыт

#про_карьеру_по_субботам

Читать полностью…

Как же стать молодым Шерлоком? Элементарно, Ватсон!

За последнее время на вебинарах и в постах мы не раз убеждались, что патогенные мутации скрываются от генетиков, словно преступники, а интерпретация — вообще сплошной детектив. Чтобы превратиться в первоклассного охотника за вариантами, нужно набивать руку и решать задачи. Поэтому на тарифах «КлинПрактика» и «КлинМентор» курса «NGS в наследственных заболеваниях» для участников заготовлены серьезные домашки и клинические кейсы, над которыми придется изрядно попотеть. Подробнее — на карточках.

😍 Напоминаем, что повышение цены на курс — нынче ночью в 23:59 мск. Если вы еще не с нами, то милости просим на Бейкер-стрит

Свои вопросы смело пишите миссис Хадсон Варваре или Еве, либо на почту varvara@blastim.ru

Читать полностью…

🦸‍♂️ Бластим спешит на помощь

Бывает же такое: только собирались спокойно поработать, а тут уже майские выходные 😱

Если вы уже начали переживать, чем бы себя занять, то спешим вас успокоить!

Мы решили не оставлять вас наедине со свободным временем и открыли доступ к коллекции видеоуроков и другим образовательным материалам.

Вас ждут:
— Python
— статистика
— ИИ
— анализ NGS
— карьерные стратегии

Достаточно перейти по ссылке на наш сайт и войти в личный кабинет: https://agency.blastim.ru

А если у вас его еще нет личного кабинете, то зарегистрироваться можно здесь: ссылка

И все это абсолютно бесплатно ☺️

Переходите, выбирайте и проводите выходные продуктивно…раз уж даже погода на это намекает

Читать полностью…

Почему врачи посылают на три буквы?

А иногда даже на четыре! Речь, конечно, про FISH, aCGH, CMA, MLPA, WES и WGS. Аббревиатуры, возможно, звучат непонятно, однако, уверяем вас, за ними стоят мощнейшие методы медгенетики. Чем именно отличаются технологии по разрешающей способности? Какие pros и cons каждого подхода? Какие методы устарели, а какие не стоит сбрасывать со счетов? А может вообще без дорогущих генетических тестов, а?

Вместе с преподавателями курса «NGS в наследственных заболеваниях» разберем теорию, отдельные заболевания, варианты диагностики и кейсы из практики

Будет крайне полезно не только молодым специалистам, но и матерым калачам — для обмена опытом и участия в дискуссии

Скорее регистрируйтесь, начинаем в 19:15 мск: https://s.salebot.pro/ngs

Читать полностью…

💎 Друзья, мы с хорошими новостями

Вебинар «Не NGS-ом единым: спектр методов в медицинской генетике» всё же состоится!

📆 Новая дата и время: 29 апреля в 19:15 мск

✅ Поговорим о том, как сегодня выстраивается диагностическая воронка и где проходит граница между «достаточно» и «избыточно»
✅ Разберем ключевые подходы от классической цитогенетики до NGS, сравним их возможности и ограничения
✅ Расшифруем все те самые FISH, MLPA, WES и другие аббревиатуры
✅ Обсудим реальные врачебные кейсы и попробуем ответить на вопрос: всегда ли нужны молекулярно-генетические методы или иногда можно обойтись более простыми решениями

🤩 Регистрируйтесь, если еще нет: https://s.salebot.pro/ngs

P.S. Всем, записанным ранее, обязательно придет рассылка с подключением

Читать полностью…

Лето обещает быть жарким: будем развиваться и работать

Собрали для вас свежий анонс ближайших курсов Бластим. Расписание получилось очень насыщенным 🔥

А еще! Многие участники идут с нами из курса в курс, поэтому мы решили оставить пакетные предложения на постоянной основе. Теперь не нужно ждать акций — выгодные комбинации доступны всегда. Мы уже обновили страницы программ, и там легко найти самые популярные наборы 👌

NGS в наследственных заболеваниях
Когда: 18 мая
Ссылка: agency.blastim.ru/ngs_genome

ИИ в научной работе
Когда: июнь 2026
Ссылка: agency.blastim.ru/scientist_of_the_future

Soft skills для карьеры в науке и индустрии
Когда: 22 июня – 14 июля
Ссылка: agency.blastim.ru/soft_skills

Машинное обучение на Python
Когда: июль 2026
Ссылка: agency.blastim.ru/pythonandml

Экспресс Linux для NGS
Когда: август 2026
Ссылка: agency.blastim.ru/expresslinux

Анализ NGS-данных
Когда: сентябрь 2026
Ссылка: agency.blastim.ru/ngs

Статистика, R и анализ данных
Когда: октябрь 2026
Ссылка: agency.blastim.ru/stat_r

Карьера в науке и не только
Доступен всегда
Ссылка: agency.blastim.ru/career

Python для анализа данных в науке
Курс в записи
Ссылка: agency.blastim.ru/pythonfordatascience

n8n с нуля для создания ИИ-агентов в науке и бизнесе
Курс в записи + возможность задать вопросы
Ссылка: agency.blastim.ru/n8n

🔗 Заходите на страницу курса, который давно откладывали, и смотрите, какие комбинации можно собрать.

Осторожно! Есть риск подхватить мотивацию и замахнуться на большее.

#бластим_дайджест

Читать полностью…

💉 ОАК вам что-нибудь говорит?

Можно ли сегодня представить работу врача-клинициста в отрыве от лабораторной диагностики? Конечно, нет. Всё так или иначе начинается с ОАК, биохимии, гормонов и других исследований — без них невозможны ни дифференциальная диагностика, ни постановка диагноза. А что уж говорить про диспансеризацию и различные чекапы, где первым делом сдают анализы.

Если вы врач, специалист КЛД или интересуетесь AI в биомедицине, то наши коллеги из HealthNet зовут на встречу клуба «Цифровая медицина». На этот раз горячие разговоры с разработчиками AI-платформ для лабораторной диагностики.

Узнаем, как искусственный интеллект чувствует себя в интерпретации показателей крови, предсказывает риски ССЗ, онкологии и диабета, а также внедряется в полевую практику

#бластим_рекомендует следить за здоровьем и прийти послушать 👍

Читать полностью…

Всероссийская школа по нанотехнологиям Nano>FEST’26

С 6 по 14 июля 2026 года в МФТИ пройдет программа дополнительного профессионального образования «Основы нанотехнологий и тераностики». Школа Nano>FEST’26 объединит студентов, интересующихся нанотехнологиями, биомедициной и системами адресной доставки. До завершения приема заявок остается всего неделя!

Что вас ждет?

✨ лекции ведущих ученых о нанотехнологиях, персонализированной медицине и системах адресной доставки лекарств
🔬 практикумы по синтезу наночастиц и работе с современными биотехнологическими платформами
🧫 мастер-классы по микроскопии, гистологии и методикам анализа наночастиц
🏛 занятия, подготовленные Лабораторией канцерогенеза и Центром инженерной биологии Института Биофизики Будущего МФТИ
🌍 живая атмосфера Физтеха: кампус, лаборатории и люди, с которыми потом не хочется расставаться

➤ Участие в школе бесплатное (по конкурсному отбору)
➤ Участники получают официальные приглашения для компенсации проезда и проживания, а также удостоверение о повышении квалификации

🔗 Заполнить форму: https://forms.yandex.ru/u/69cbbdf484227cafe1f2f0d0/

• Подача заявок: до 30 апреля 2026 (23:59 мск)
• Как это было в прошлом году: тут, тут и тут
• Следите за новостями

#бластим_рекомендует

Читать полностью…

NGS в массы! Место NGS в современной медицине

Проект «Геном человека» занял более 10 лет и стоил миллиарды долларов. Сегодня технологии секвенирования нового поколения стали частью повседневной клинической практики, а сам анализ выполняется за часы. Его даже дарят на дни рождения... Это действительно прорыв, меняющий медицину, или шуточный тест «а мог ли я стать олимпийским чемпионом»?

Приглашаем на новый вебинар от Бластим, где разберемся без преувеличений:
• в каких случаях генетика влияет на выбор терапии
• когда NGS помогает поставить диагноз и оценить риски
• где персонализированный подход уже работает, а где остается обещанием
• какие заблуждения мешают использовать технологии с максимальной пользой

🗓 Когда: 23 апреля в 19:15 мск

Опытом поделятся специалисты ЦГРМ «Генетико», которые ежедневно интерпретируют генетические данные и точно знают, где заканчиваются красивые теории и начинается клиническая реальность.

🔗 Регистрация по ссылке: https://s.salebot.pro/ngs

Присоединяйтесь, если хотите наконец понять, где проходит граница между пользой и хайпом вокруг NGS

Читать полностью…

От данных к диагнозу: клинический NGS без пробелов в понимании

На вопрос, кому подойдет курс «NGS в наследственных заболеваниях», можно ответить коротко. Но мы выберем формат short story long, потому что этот курс создавался на основе скрупулезного анализа запросов врачей разных специальностей и не только 🖋

Вы врач-онколог и сталкиваетесь с наследственными опухолевыми синдромами, но:
• сложно выбрать правильный тест
• нет времени разбираться в нюансах методов
• есть риск ошибки при интерпретации

Вы педиатр и сталкиваетесь с NGS редко, но:
• неясно, когда исследование действительно нужно
• трудно выстроить коммуникацию с лабораторией и пациентом
• не хватает понятного алгоритма разбора результатов

Вы неонатолог и чаще направляете к генетику, но:
• хотите разбираться самостоятельно
• выбор метода вызывает сомнения
• неясно, как учитывать фенотип и семейный анамнез

Вы врач другой специальности и работаете с генетикой эпизодически, но:
• нет общей картины и базовых знаний
• сложно ориентироваться в заключениях
• непонятны ограничения методов

Вы биоинформатик или биолог и давно работаете с данными, но:
• не хватает клинического контекста
• не до конца ясно, как принимаются решения
• хочется понимать, что происходит после анализа

Вы хотите перейти в клиническую интерпретацию, но:
• нет понятной точки входа
• требования выглядят размыто
• одной теории недостаточно без практики

Если вы узнали себя хотя бы в одном пункте, то наш новый курс поможет закрыть все пробелы в компетенциях между анализом данных и клиническим решением.

На курсе вы:
→ выстроите целостное понимание принципов NGS
→ разберетесь в ключевых инструментах и базах для клинического анализа
→ научитесь читать заключения и принимать решения на основе реальных кейсов

Подробнее: agency.blastim.ru/ngs_genome

А с любыми вопросами можно написать нашим @varvara_blastim или @eva_blastim ✉️

Читать полностью…

Если проблему можно решить с помощью денег, то это не проблема, это расходы

Сегодня #бластим_рекомендует всем-всем ученым познакомиться с новой AI-платформой eternalsearch.net, которая находит гранты, инвесторов и партнеров для исследований. Ее придумали наши коллеги из Open Longevity, и Бластим тоже участвует.

Если вам интересно узнать, где найти финансирование для своих научных проектов и как LLM работают в продакшне, то приходите на воскресный вебинар и задавайте свои каверзные вопросы, чтобы усовершенствовать систему и сделать ее еще полезнее. Подробности в посте ниже:

Читать полностью…

⚠️ Друзья, к сожалению, мы вынуждены отменить сегодняшний вебинар по независящим от нас причинам. У основного спикера возникли форс-мажорные обстоятельства. Актуальная информация будет здесь и в наших рассылках.

Приносим извинения за неудобства. Мы знаем, что вы очень ждали эту встречу, поэтому дарим запись вебинара «Может ли мультиагентный ИИ заменить ручную работу в геномике?» с Алексеем Зарубиным, чтобы приятно провести этот пятничный вечер:

🔗 https://rutube.ru/video/private/985c379deb8c10df9d80b9bcb8fc30e0/?p=l0HUcUciGP6kcOvH4IT32w

Читать полностью…

💅Модный не значит полезный

NGS — это, безусловно, прорыв для диагностики наследственных болезней. Но всегда ли он так необходим? Во-первых, стоимость секвенирования, хотя и упала с трех миллиардов до сотен долларов, всё равно остается высокой. Во-вторых, направлять пациентов на полный экзом или геном иногда просто избыточно, ведь диагноз можно поставить и без этого. В-третьих, у технологии существуют ограничения. Именно поэтому до сих пор живут и здравствуют старые добрые методы медгенетики.

Что это за методы такие, почему NGS им уступает и в каких ситуациях все-таки придется секвенировать — об этом мы подробно поговорим с экспертами Genetico на вебинаре в пятницу. Начнем с классической цитогенетики и доберемся до самого передового.

🔗 Регистрация по ссылке: https://s.salebot.pro/ngs170426_1

До встречи в эфире!

Читать полностью…

Без вариантов никто не останется

Кому-то нравятся лекции в записи, кто-то не может жить без живого общения с преподами. Кто-то исписывает тонны страниц конспектов каллиграфическим почерком, а кто-то схватывает всё методом пристального взгляда. Одни приходят за знаниями, другие — за корочкой, третьи — и за тем, и за другим. Мы разные, обстоятельства разные.

Поэтому на курсе «NGS в наследственных заболеваниях» Бластим предлагает три формата прохождения, чтобы каждый мог выбрать свой вариант и... научиться интерпретировать варианты! Подробности смотрите на инфокарточке и странице курса: https://agency.blastim.ru/ngs_genome

❗️Что самое важное? На первых двух тарифах не предполагается выдача удостоверения гособразца. А вот «КлинМентор» создан специально для тех, кто планирует регулярно работать с NGS-результатами и хочет серьезно прокачать клиническую чуйку. В конце — аттестация и получение документа о повышении квалификации по программе ДПО «Клиническая интерпретация данных NGS» (24 академических часа).

Нужна детальная консультация? Напишите нам: @varvara_blastim или @eva_blastim

Читать полностью…

Юра, мы всё наверстаем

Вчера на Землю вернулся экипаж Artemis II — первая за более чем 50 лет пилотируемая миссия, облетевшая Луну и успешно возвратившаяся обратно. Четыре астронавта провели почти 10 дней в глубоком космосе, протестировали корабль Orion, системы жизнеобеспечения и радиационную защиту. И это уже серьезный шаг к созданию лунной инфраструктуры для самых разных задач, включая научные исследования.

И нас, как биологов, здесь интересует вполне конкретная вещь: поиск следов жизни 👽

Но даже если не брать такие амбициозные цели, большинство экспериментов в молекулярной биологии опирается на то, что давно стало рутиной — секвенирование.

А будет ли оно таким же надежным за пределами Земли?

Ответ на этот вопрос появился еще в 2020 году. Группа исследователей из Massachusetts Institute of Technology напрямую проверила, можно ли проводить секвенирование ДНК во внеземных условиях. Для этого использовали устройство Oxford Nanopore MinION и протестировали его в:
• микрогравитации (параболические полеты)
• условиях, соответствующих гравитации Луны и Марса
• среде с сильными вибрациями

Результат оказался вполне однозначным. Секвенирование не просто возможно, оно устойчиво к условиям космических миссий:

• устройства компактны (~130 г) и энергоэффективны (<2 Вт)
• электроника и расходные материалы выдерживают радиационные нагрузки (для Марса, Венеры, Энцелада)
• изменения гравитации не становятся критическим фактором
• вибрации практически не влияют на качество данных

Это означает, что больше не обязательно доставлять образцы на Землю для анализа ДНК. Соответственно, можно избежать искажений, связанных с транспортировкой, хранением и контаминацией.

💕 Пока в фантастике мы спасаем звезды от космических фагов, в реальности шаги скромнее, но, возможно, именно они окажутся куда более революционными.

Читать полностью…

😁😆😁 👍👍👍👍Вам это тоже действует на нервы? Вот и нам! Чтобы снять раздражение, мы решили сегодня пойти... куда? Пишите догадки в комментариях

Читать полностью…