🎵 Последняя часть аудиоверсии подкаста Михася Михаила Камха в Бластим

Слушайте, внимайте и поступайте на курс, чтобы делать клинические исследования грамотно

Читать полностью…

⚠️ Внимание, внимание: 15 сентября закрывается регистрация на кейс-чемпионат «Будущее медицины»

Основной этап пройдет с 21 по 27 сентября. Участники будут решать реальные задачи на стыке медицины, физики и технологий, а все кейсы предоставлены лабораториями ведущих университетов.

Если нет команды, то до 12 сентября можно подать заявку на подбор группы — не забудете указать роль, которая вам подходит.

Сохраняйте даты:

• 7–11 сентября | серия семинаров от экспертов, сможете глубже погрузиться в задачи, понять контекст и познакомиться с будущей командой
• 11 сентября | очный семинар «Прикладные ИИ решения в медицине: собираем своего агента» на площадке Пироговского Университета
• 21–27 сентября | основной этап, работа над задачами
• 28 сентября — 2 октября | защита проектов
• 10 октября | питч-сессия финалистов на площадке Пироговского Университета

Регистрация по ссылке: https://future-of-medicine.rsmu.ru/

Следите за новостями:
📱 Telegram 📱 ВКонтакте

🤌 Псс... Бластим готовит секретный приз для победителей и участников — так что ждем вас на соревновании  

#бластим_рекомендует

Читать полностью…

Если ЕГЭ — то с ФББ 🫥

Друзья, сегодня порекомендуем еще одну полезную активность, которую помимо магистратур и программ ДПО организовали наши коллеги с факультета биоинженерии и биоинформатики. Речь про подготовку к ЕГЭ, ДВИ и олимпиадам.

Если вы старшеклассник, выпускник колледжа, абитуриент, родитель или знаете тех, кто планирует поступать в высшие учебные заведения, то обратите внимание на программы:

💚 Годовая подготовка к ЕГЭ по биологии, химии и профильной математике. Длится с сентября по май. Занятия проходят один раз в неделю, треть времени посвящается разбору экзаменационных заданий — с акцентом на четкие, логичные ответы по критериям ЕГЭ. Старательные слушатели стабильно набирают 85–90+ баллов.

💚 Олимпиадная биология для 9–11-классников. Более 250 академических часов занятий и лекций от ученых МГУ. Уже в первом семестре некоторые ученики без опыта в олимпиадах выходят на региональный этап Всероса.

💚 Подготовка к дополнительному вступительному испытанию в МГУ по математике. Здесь разбирают задачи повышенной сложности, требующие нетривиального мышления.

❗️Места в группах подготовки к ЕГЭ на 2026/27 учебный год заканчиваются — успейте записаться!

Подробности: сайт дополнительного образования

#бластим_рекомендует

Читать полностью…

6 ЧАСОВ ДО КОНЦА РАСПРОДАЖИ. ЗАКУПАЙТЕСЬ КУРСАМИ НА ДВЕ ТЫЩИ ДВАДЦАТЬ СИКС-СЕВЕН УЧЕБНЫЙ СЕЗОН

Читать полностью…

А голову ты дома не забыл?

И правда, мы так спешили к первому звонку, что забыли подробнее рассказать вам о пакетах на распродажу в честь 1 сентября! Выходим и заходим нормально.

🎒 Первый раз в первый класс: пакет «Первоклашка»

Собираем профессиональный рюкзак по анализу данных: много Python и R, а также Linux, статистика, NGS и ИИ

🙋‍♂️ Лес рук: пакет «Средняя школа»

Осваиваем мегапопулярный курс «Анализ NGS-данных» и формируем базовый набор навыков молодого биоинформатика

🧠 Воспаление хитрости: пакет «Старшеклассник»

Для тех, кто выбрал узкий профиль: переходим от рутинной обработки NGS-данных к клинической интерпретации

🔔 Звонок для учителя: пакет «Выпускник»

Взрослая жизнь, где мы внедряем ИИ в работу, прокачиваем софтскиллы на максимум и делаем собственный продукт

📋 Остаться после уроков: пакет «Внеклассная работа»

Погружаемся в базовый R и tidyverse, учимся грамотно применять статметоды и рисовать понятные визуализации

Пакет с пакетами лежит по ссылке

⏳ Распродажа действует 48 часов. Не оставляйте образование на второй год

Читать полностью…

Заканчивается лето, многие эксперты в биоинформатике и машинном обучении исчезают из интернета. Они идут в школу

Читать полностью…

🧬 Загляни в «Будущее Медицины» уже сегодня

Бластим создавался учеными для ученых. Мы знаем, что путь в науку начинается с фундаментальных знаний, но настоящий рост происходит только тогда, когда теория подкрепляется практикой — когда вы работаете с реальными данными, решаете задачи и видите, как ваши результаты могут изменить мир. Но как найти такой проект?

Прекрасный вариант — кейс-чемпионаты и хакатоны. Это шанс попробовать себя в деле, собрать команду, познакомиться с компаниями и пополнить портфолио. И у нас для вас отличная новость!

Бластим стал информационным партнером кейс-чемпионата «Будущее Медицины» 🦾

Это недельный спринт, в котором команды решают прикладные задачи на стыке медицины, ИИ и физики. Участников ждут пять задач, сформулированных ведущими лабораториями на основе реальных данных и запросов рынка. После чемпионата вы сможете продолжить проект и работать над тем, что найдет применение в клиниках и научных центрах.

📌 Организаторы чемпионата: Пироговский Университет и Физический факультет МГУ
📌 Технологический партнер: Yandex Cloud

Хотите познакомиться с задачами поближе? На чемпионате пройдут открытые семинары — там объяснят, как технологии меняют медицину и систему здравоохранения. Ловите расписание:

💡 7 сентября, 16:00 мск | онлайн
«Лечение и диагностика светом — как это возможно?!»
Говорим о биофотонике и том, на что способна сила света в медицине.
👤 Спикеры:
Борис Якимов, к.ф.-м.н., автор 50+ научных работ и курса по ML-аналитике;
Надежда Корнева, к.ф.-м.н., разработчик системы безопасной хирургической навигации;
Илья Бардадин, сотрудник отдела медицинских разработок VPG Laserone.

🧠 9 сентября, 16:00 мск | онлайн
«От сигналов мозга к действию: нейроинтерфейсы для клиники и реабилитации»
Всё о силе мысли в медицине: как работают интерфейсы «мозг-компьютер» и кому они уже помогают.
👤 Спикер:
Павел Бобров, к.б.н., с.н.с. отдела нейрокомпьютерных интерфейсов Пироговского Университета.

🤖 11 сентября | очно, площадка Пироговского Университета
«Прикладные ИИ-решения в медицине: собираем своего агента»
Погружаемся в мир ИИ и создаем собственного помощника для здравоохранения. Ноутбук с собой — обязательно! А после — нетворкинг и живое обсуждение для всех вовлеченных.
👤 Спикер:
Юлия Шеянова, менеджер проектов в здравоохранении, Yandex Cloud.

🔗 Участвуйте в семинарах, бросайте вызов себе и другим командам. Регистрация уже открыта: https://future-of-medicine.rsmu.ru/

Следите за новостями проекта в Телеге и ВКонтакте

«Будущее медицины» уже наступает. Успейте стать его частью!

#бластим_рекомендует
#про_карьеру_по_субботам

Читать полностью…

🗓 Закрываем неделю предобучения и говорим про Oxford Nanopore

Мы всегда стараемся собирать в программе наших курсов то, что действительно необходимо в современной науке и биотехе. А еще внимательно прислушиваемся к вашим пожеланиям. Так, в предыдущем запуске «Анализа NGS-данных» мы добавили в программу целый новый блок по Oxford Nanopore Technologies (ONT).

Нанопор уже не экзотика, а важная часть геномики. Поэтому понимание принципов этой технологии становится такой же базой, как и знакомство с другими подходами к секвенированию.

▶️ Сегодня предлагаем разобраться, как работают приборы ONT и в чем особенности этого метода.

Поговорим о:
• возможностях технологии для анализа ДНК и РНК
• реальных примерах применения в научных исследованиях и медицине

Спикер — Владислав Бабенко, научный сотрудник лаборатории геномных исследований и вычислительной биологии ФГБУ ФНКЦ ФМБА.

И отдельное спасибо тем, кто ответственно выполняет ДЗ! Мы все проверяем и готовим вам подарки.

Регистрация в личном кабинете для доступа ко всем бесплатным урокам здесь: https://agency.blastim.ru

Читать полностью…

🏝 Job of the Day: Bioinformatician / PostDoc

MBZUAI is ranked among the top 10 universities globally in computational biology and core AI fields, according to CSRankings. Currently, MBZUAI is looking for a Bioinformatician (PostDoc) to join a project studying neurodegeneration at single-cell resolution. The project aims to identify the cellular changes that drive disease and detect them across the wider patient population.

The project combines unique, deeply characterised patient tissue profiled with purpose-built assays, large public single-nucleus atlases of the human brain, and advanced AI/ML methods — building transfer-learning models that recover disease signatures in data where the underlying measurement was never made. A rare opportunity to work at the intersection of single-cell genomics, machine learning, and translational neuroscience.

Required qualifications:

• Master's degree or PhD in Bioinformatics, Computational Biology, Machine Learning, or a related field
• Strong programming skills in Python and R
• Experience with high-performance computing (HPC) environments and the Linux command line
• Demonstrated experience with single-cell data formats and tools (Cell Ranger, Scanpy, Seurat) and knowledge of standard single-cell workflows
• Demonstrated experience building and evaluating machine-learning models on high-dimensional data
• Experience with deep learning frameworks (PyTorch, TensorFlow) and single-cell representation learning (e.g., scVI, transfer learning, single-cell foundation models)

Key responsibilities:

➤ Process single-cell and single-nucleus RNA-seq data, from raw sequencing through to annotated cell atlases
➤ Develop, benchmark, and validate machine-learning models linking cellular molecular states to disease status and clinical phenotype
➤ Apply models to large public single-cell atlases and validate predictions against orthogonal evidence
➤ Perform differential expression, cell-state, and pathway analyses, and interpret results in a disease context
➤ Collaborate with an interdisciplinary team of experimental biologists, clinicians, and computational scientists
➤ Document analysis pipelines, ensure reproducibility, and contribute to peer-reviewed publications

Conditions:

• Full-time position
• 2–3 year fixed-term contract
• Location: MBZUAI, Abu Dhabi, UAE
• Competitive salary and benefits package
• Access to world-class datasets and computational resources
• Opportunity to contribute to pioneering, high-impact research
• Collaborative and supportive research environment

🛫 Apply now: send your CV, a brief cover letter describing your relevant experience, and contact information for two references to alla.mikheenko@mbzuai.ac.ae

🔗 More details on our website: blastim.ru/job/15924/

#бластим_вакансии

Читать полностью…

▶️ Продолжаем разбираться в основах секвенирования

Второе занятие недели бесплатного предобучения по курсу «Анализ NGS-данных уже доступно!

На этот раз говорим об основных методах: какие платформы существуют, чем они отличаются друг от друга и какие ошибки характерны для разных приборов.

И обязательно сделайте ДЗ. Так вы не просто посмотрите очередной видосик, а сможете проверить себя и закрепить материал.

Вопросы для самоконтроля:

Что такое UMI? Что такое base calling?

В какой технологии секвенирования используется мостиковая ПЦР? А в какой работает метод катящегося кольца?

В чем отличие технологий секвенирования 2-го и 3-го поколения?

Как рассчитывается покрытие генома?

Какие основные этапы включает NGS-пайплайн?

Напоминаем, чтобы получить доступ к урокам, нужно зарегистрироваться в личном кабинете: https://agency.blastim.ru

Приятного просмотра!

Читать полностью…

Клинтриалы в России: онлайн-встреча завершилась, но разговор продолжается

Сегодняшний вебинар получился очень насыщенным — обсудили много вопросов, но, конечно, осталось еще немало интригующих тем. И теперь нам хочется вернуться к одному из моментов, который не всегда становится предметом открытого обсуждения:

❓ Сталкивались ли вы со скепсисом в отношении клинических исследований в России? С тем, что отечественным центрам заранее приписывают более низкое качество и воспринимают их как менее подготовленные по сравнению с зарубежными?

Но насколько это действительно так? Отвечает Михаил Камха, преподаватель программы ДПО по системе менеджмента от ФББ МГУ:

Коллеги, позвольте задать вам принципиальный вопрос, который часто обсуждается в профессиональном сообществе. Неужели мы, наши врачи и наши научные школы чем-то хуже наших коллег в США, Европе или Китае?

Безусловно, нет. Уровень нашей клинической мысли и медицинской экспертизы находится на высочайшем мировом уровне. Однако если мы говорим об управленческих подходах к качеству клинических исследований, здесь нам предстоит сократить определенный разрыв. Мировая практика уже совершила переход от реактивного подхода — постоянного «тушения пожаров», в котором мы порой застреваем, — к проактивной философии Quality by Design и риск-ориентированному управлению.

В российском контексте этот вызов имеет свою специфику. Мы активно используем данные из различных медицинских информационных систем в качестве первичной документации. Но как отмечается в современных аналитических обзорах, отсутствие их формальной валидации по стандартам GAMP 5 создает скрытые регуляторные риски и ставит под вопрос соответствие данных принципам ALCOA+ при международных инспекциях. Это не приговор. Это точка роста. А обновленные правила GCP ЕАЭС и гармонизация с ICH E6(R3) дают нам четкий вектор.

На нашем курсе я предлагаю вам не просто теорию, а практическую дорожную карту. Мы разберем, как адаптировать международные стандарты ISO и GAMP 5 к российским реалиям, чтобы ваши исследовательские центры не просто соответствовали требованиям, а задавали стандарты качества для всего евразийского пространства и рынков БРИКС.

От обилия новых терминов закружилась голова? Понимаем вас! На этот случай Бластим вместе с Михаилом Камха подготовили гайд «20 красных флагов исследовательского центра», где мы расшифровали бюрократические аббревиатуры и снабдили сложные концепции неформальными пояснениями.

Забрать материалы от спикера можно, заполнив форму на сайте: ссылка

Читать полностью…

АНТОН ТИХОНОВ. БОЛЬШОЕ ИНТЕРВЬЮ 💊💊💊

Готово ли человечество к эпидемии хантавируса? Пророчества Бориса Черного сбываются в фарме? Как Брайан Джонсон прошляпил аутоиммунку? Чем ЗОЖ отличается от лонжевити? Почему давление — это классная штука?

В июле Вита Степанова встретилась с добрым другом Бластима и опытным экспертом в области RnD лекарств Антоном Тихоновым из «Петровакса». Разговор зашел о самых горячих темах последних лет: Клод Коде и Оземпике, продлении жизни и фармлобби, молекулярных клеях и даже Трое.

➡️ Только на нашем сайте: https://agency.blastim.ru/media/tpost/g82bcv8hb1-intervyu-s-antonom-tihonovim

Читайте. Комментируйте. Делитесь

#про_карьеру_по_субботам

Читать полностью…

Онлайн-встреча с Михаилом Камха: от слов к делу

Мы уже говорили о том, почему привычные подходы к организации клинических проектов постепенно меняются и зачем исследовательским площадкам переходить к более современным моделям работы. Но закономерно возникает следующий вопрос: а как именно их внедрять на практике?

Предлагаем обсудить это в прямом эфире вместе с Михаилом Камха — преподавателем Передовой инженерной школы МГУ на базе ФББ МГУ — уже в это воскресенье, 23 августа, на бесплатном вебинаре в 13:00 мск:

«Как провести клиническое исследование в центре так, чтобы "и волки были целы, и овцы сыты", а у аудитора перестал дергаться глаз»

Разберемся, как выстраивать процессы, чтобы требования к качеству не оставались только на бумаге, а система действительно работала — и для команды, и для спонсора, и, конечно, для аудитора.

Эта встреча будет полезна не только тем, кто уже руководит клинтриалами или исследовательскими центрами. Если вы только начинаете свой путь, учитесь или просто хотите лучше понимать, как устроена эта сфера изнутри, — вам тоже будет интересно!

Регистрация в боте: /channel/fbbmsu_bot
Если не работает, то записывайтесь на сайте: https://agency.blastim.ru/qms#kamkhaweb

Читать полностью…

🎵 Изучайте программу и слушайте аудиоверсию подкаста Михаила Круга Камха в Бластим

Читать полностью…

У нас пополнение: к команде легендарного курса «Анализ NGS-данных» присоединилась Александра Галицына 🎉

Друзья, отличные новости: Александра не только прочтет вводный вебинар, но и будет вести основные занятия на самой востребованной программе Бластим. Ура!

Александра Галицына — вычислительный биолог мирового уровня и, без всяких преувеличений, человек, находящийся на переднем крае науки о трехмерной организации генома. Еще в школе она увлекалась математикой и биологией, поэтому поступила на ФББ МГУ. Со второго курса Александра занимается хроматином и регуляцией генов. Старт ее академической карьеры практически совпал с активным внедрением Hi-C. Так Александра оказалась среди пионеров области в России. 

Саша защитила PhD в Сколтехе. Ее диссертация была посвящена пространственной структуре хроматина в единичных клетках (scHi-C) дрозофилы. Поясним: обычные Hi-C матрицы — это «средняя температура по больнице», сигнал от целого образца. Поэтому ТАДы, хорошо видимые на агрегированной карте, не обязаны существовать в отдельных клеточках. Это требует пристального внимания и особых вычислительных подходов для анализа разреженных single-cell данных. Также в аспирантуре Александра изучала, как меняется хроматин при формировании плодового тела социальной амебы Dictyostelium.

Огромный опыт Александра приобрела в постдокторантуре Массачусетского технологического института. В США Александра исследовала фонтаны — необычные паттерны, перпендикулярные главной диагонали на Hi-C картах, которые казались странным исключением, но потом нашлись у многих позвоночных в раннем эмбриогенезе. Также она была вовлечена в проект по расшифровке роли хроматина в иммунитете. В феврале 2026 года публикация про когезин в функционировании дендритных клеток украсила обложку журнала Science Immunology.

Александра использует современные методы и интегрирует разные омики — Hi-C, ChIP-seq, ATAC-seq, bulk и scRNA-seq. Также ученая вносит вклад в разработку новаторских биоинформатических инструментов. Например, при ее участии был создан пакет pairtools для удобной трансформации сырых данных секвенирования в хромосомные контакты.

Мы очень рады, что Александра будет преподавать в Бластиме. Приходите 20 августа познакомиться и подружиться!

Читать полностью…

🙁 GCP, ICH E6(R3), ISO 9001, ISO 31000, GAMP 5, ALCOA+…

Если вы сейчас подумали: «Так, а можно на человеческом?» — мы вас понимаем!

Клинические исследования давно не сводятся к тому, чтобы открыть нужную методичку, найти пункт, поставить галочку и двигаться дальше. Всё усложняется, и дальше требований, стандартов и новых подходов к организации исследований будет становиться только больше. И у врача может возникнуть вполне закономерный вопрос: «Я вообще-то шесть лет учился медицине. Потом еще ординатура, практика, исследования… Почему теперь мне нужно разбираться еще и во всем этом?»

Не пугайтесь. За большинством сложных формулировок и аббревиатур стоят вполне понятные вещи. Важно увидеть общую логику: как устроена работа исследовательского центра и как сделать так, чтобы она не зависела от памяти одного человека и папки с методичками. Именно этому посвящена программа ДПО по направлению «Менеджмент» от ФББ МГУ. Она создана прежде всего для специалистов с медицинским бэкграундом. Поэтому не предполагается, что вы уже умеете разговаривать на языке из десяти аббревиатур подряд.

На курсе всё раскладывается по полочкам: что действительно важно знать специалисту, как связаны между собой разные требования, где заканчивается простое следование инструкции и начинается полноценное управление качеством. И главное, как применять эти знания в реальной работе исследовательского центра. Вы не «выучите еще 150 страниц правил», а разберетесь, как устроена вся система целиком.

А если уже сейчас хочется понять, что скрывается за всеми этими GCP, ICH, ISO и GAMP 5 — Михаил Камха, преподаватель программы, подготовил методичку «20 красных флагов исследовательского центра».

🔗 Забрать материалы или получить консультацию можно на сайте: https://agency.blastim.ru/qms

Читать полностью…

🍃 Осень — время грантов, возможностей и костров рябин

Занимательная статистика: после последнего августовского апдейта в базе GenBank доступно уже 6,68 биллиона записей. И объемы генетических данных не прекращают расти ни на минуту. А вместе с количеством информации растет и нагрузка, падающая на плечи биоинформатиков.

Сейчас ученые часами решают типовые задачи, запускают одни и те же процессы, формируют отчеты. Хорошо, конечно, когда пайплайны стандартизированы, настроены и работают как часы. Но технологии не стоят на месте, возникают новые тулзы и подходы, особенно иишные, которые ускоряют, упрощают, облегчают анализ. Вот только следить за всеми новинками — отдельная работа. А понимать, что действительно стоит внедрять и когда пора перестроить привычные процессы — уже задача с двумя звездочками 🤓

Можно ли не отставать от мира без лишней перестройки? Мы в Бластиме уверены, что можно

⚡️ Для команд от 5 человек из одной организации на курсе «Анализ NGS-данных» мы поможем обновить подходы к работе с учетом ваших реальных задач. Вы приводите команду — наши эксперты-преподаватели помогают подобрать подходящие инструменты и методы.

Что вы получаете:
• экономию времени
• актуальные знания

Но это еще не всё — у нас есть несколько преимуществ, которые выделяют нас среди других образовательных проектов:

• сертификат о прохождении ДПО государственного образца: официальное подтверждение ваших навыков, которое можно смело добавлять в резюме и засчитывать в часы повышения квалификации
• гибкие условия оплаты: мы работаем с тендерами, постоплатой и грантами. Понимаем, что у организаций бывают разные финансовые возможности, и стараемся подстроиться под вас
• полный пакет закрывающих документов: и бухгалтеры сыты, и ваши нервы останутся целыми
• поддержка при любых сложностях: помогаем со всеми техническими вопросами
• все новые навыки применимы к работе сразу после обучения: никакого разрыва между теорией и практикой — вы обучаетесь тому, что будете использовать уже завтра

🫶 Нужно научить команду анализу NGS-данных и освободить от лишней рутины? Пишите Варваре @varvara_blastim или на mail@blastim.ru. Проведем бесплатную консультацию, обсудим ваши запросы и подберем для вас оптимальный формат обучения.

#бластим_корпоративный

Читать полностью…

НИКТО. АБСОЛЮТНО НИКТО. БЛАСТИМ НА НОЧЬ ГЛЯДЯ:

Читать полностью…

Я календарь переверну, и снова 1 сентября 🍃

Друзья, поздравляем всех с Днем знаний! Это особый праздник для Бластима, потому что в образовании и просвещении заключен весь смысл нашей работы. 

Сооснователи компании Юра Пеков и Вита Степанова когда-то тоже были юными и слегка наивными выпускниками ФББ МГУ (красавчики на фото). Но они быстро осознали: чему учили в вузе и что требуется в реальной работе — вещи (не)много разные. Чтобы лично разобраться в набирающем обороты NGS, а также сориентироваться на хаотичном рынке труда, друзья и замутили проект «Бластим».

Сейчас компания выросла и эволюционировала, но концепция неизменна: мы делаем курсы и другие продукты как для самих себя. И мы всегда держим фокус на релевантных навыках в науке. Без оторванной от земли теории, а так, чтобы сразу после урока взять и применить знания «в поле»: проанализировать табличку в Pandas, посчитать t-тест или построить ИИ-агента.

🔔 Если вы давно хотели пройти что-то из линейки наших программ, то напоминаем: сегодня до 23:59 мск открыта большая распродажа полезных пакетов по акционным ценам. Места еще есть! Присоединяйтесь к Бластим, пока не прозвенел последний звонок. А также на сайте можно узнать про новинку — готовые траектории курсов на целый год, которые доступны в любое время.

Посмотреть учебный план 👩‍🎓

Желаем всем нам провести этот сезон умно, продуктивно и иишно 🎉

Читать полностью…

Сикс? Севен? Пятерка ко Дню знаний от Бластим!

Если б вам выпал шанс вернуться за парту и начать всё сначала, как бы вы поступили? Что-то изменили в своем профессиональном пути или оставили как есть?

Хотя зачем гадать? Для тех, кто ностальгирует по школьным временам, скрипу мела по доске, шелесту двойных листочков и радости открытий, мы приготовили уникальную образовательную возможность.

🍁 Только 31 августа и 1 сентября отдаем наши лучшие курсы со скидками до 3️⃣5️⃣🔤

Завучи Бластима разработали ПЯТЬ сбалансированных пакетов, куда попали и флагманские программы, и вспомогательные вебинары под разные уровни. Выбирайте свой «класс» и вступайте в нынешний учебный сезон с новыми уроками — не ради оценок в дневнике, а чтобы стать сильным спецом 🎒✏️📚

Бластим — это школа и второй дом: преподаватели сидят с вами на парах до ночи, помогают и не ругают, ошибаться здесь не боязно, а зубрить наизусть не требуется. Также у нас много обучения с учителем, без учителя и прочего ИИ.

Устройте БОЛЬШУЮ ПЕРЕМЕНУ в своей карьере этой осенью совместно с Бластим: https://agency.blastim.ru/sale_day

⏳ Распродажа действует 48 часов. Не оставляйте образование на второй год

Читать полностью…

$ mv freax linux

А что если бы Linux никогда не было, а был бы, скажем... Freax? Что ж, друзья, это не байт! 👀

Линус Торвальдс — тот ещё приколист: изначально хотел назвать свою систему именно так — Freax (free + freak + x, буквально «ОС для фриков»). Но админ сервера Ари Лемке, заливавший код, эту шуточку не оценил и по-тихому переименовал папку в «Linux».

Кстати, о серверах: сегодня мы тоже научимся с ними работать — подключаться по ssh-ключу и разбираться с файлами, как настоящие линуксоиды.

Программа дня:

🐧 синтаксис Bash: переменные и циклы
🐧 редактирование текстовых файлов в Vim, написание и запуск скриптов на Bash
🐧 процессы и их мониторинг в Linux, остановка и отправка процесса в фон
🐧 терминальные мультиплексоры
🐧 создание и управление виртуальными окружениями Conda

В личном кабинете интенсива вас уже ждут: запись вчерашнего занятия, презентации, доп материалы и вопросы для самопроверки.

✏️ Скорее пишите Варваре @varvara_blastim, чтобы успеть на самую интересную часть. А если вы всё пропустили — не переживайте, доступ к записи и серверу открыт до 6 сентября.

Для тех, кто учится на Linux, действует большая скидка на наш биоинформатический блокбастер «Анализ NGS-данных»

Читать полностью…

🔤🔤🔤🔤🔤 🔤🔤🔤🔤🔤🔤🔤🔤🔤 🔤🔤🔤🔤🔤

Один студент университета Хельсинки для собственного досуга решил написать свободную операционную систему, и 25 августа 1991 года появился знаменательный пост:

«just a hobby, won't be big and professional like gnu»

А уже 17 сентября вышел первый релиз кода 🎂

Наверняка вы уже догадались, кто был тем самым студентом. Конечно, Линус Торвальдс, который спустя 35 лет (в этом году юбилей!) всё еще трудится над системой, лежащей в основе всей современной айти-инфраструктуры: от бытовой техники до суперкомпьютеров.

Да, стоит признать, что у новичков Linux вызывает дискомфорт и головную боль: никакого интуитивного интерфейса, даже чтобы подключиться к Wi-Fi, нужно вводить консольную команду... Как тогда работать?! Но именно в этом весь кайф — за скупым терминалом скрывается гора возможностей.

Стало интересно? Так давайте избавляться от технологического рабства — гоу на наш культовый интенсив «Экспресс Linux для NGS», который уже идет в прямом эфире ▶️

Программа первого дня на скрине ниже ⬇️

Скорее пишите Варваре @varvara_blastim — чтобы подключиться к занятию

Читать полностью…

🔔 Третье занятие недели бесплатного предобучения по курсу «Анализ NGS-данных» уже доступно

На этот раз поговорим о том, как убедиться, что перед вами именно те образцы, с которыми вы планировали работать.

Тема: «Современные подходы к генетическому фингерпринтингу в NGS: от SNP-типирования до внешнего контроля»

Разберем:
• SNP-фингерпринтинг в NGS
• внешний контроль: Spike-in, ДНК-чипы и STR
• контроль качества и обнаружение контаминации с помощью FASTQC, GATK и CalculateContamination

Спикер — Алексей Зарубин, преподаватель нашего полного курса «Анализ NGS-данных», кандидат медицинских наук по специальности «медицинская генетика» и врач-биохимик.

И в этом еще один приятный бонус предобучения: вы не только получаете полезные материалы, но и заранее узнаете наших лекторов. Можно легко оценить, как они объясняют сложные темы, и понять, хотите ли вы продолжить обучение вместе с нами.

➕ у нас есть классное интервью с Алексеем «10 вопросов биоинформатику»

А чтобы получить доступ к этому и предыдущим урокам, зарегистрируйтесь в личном кабинете, если еще этого не сделали: https://agency.blastim.ru

Читать полностью…

Бластим утомился и отчаливает в отпуск — в круиз на Южный полюс

Однажды в зоопарке мужчину за палец укусил пингвин, и он заразился «пингвинитом». Это опасное заболевание выражается в постоянных мыслях о пингвинах и острых приступах любви к милым птицам. Тем человеком был Линус Торвальдс, который выбрал маскотом созданной им ОС Linux пингвина по имени Tux, объевшегося селедкой🥸

Мы тоже обожаем нелетающих пернатых. Поэтому в последний летний уикенд, 29–30 августа, отправляемся в экспресс-путешествие по Linux. За штурвалом — капитан Андрей Томаровский, к.б.н., специалист в области геномики животных и опытный сисадмин.

Почему зовем с нами?

Большинство биоинформатического софта написано для командной строки Линукс. На серверах, кластерах и суперкомпьютерах — везде Линукс. Анализировать тяжелые NGS-данные в графическом интерфейсе с кнопочками и окошечками не получается. В ворде или блокноте вы не откроете файл с геномом человека, потому что компьютер просто зависнет. А с помощью консольных программ с Big Data работается удобно и автоматизированно.

За два дня Андрей даст жизненно необходимую IT-базу для начинающих биоинформатиков:
🐧 философия Линукс, ключевые команды, хоткеи
🐧 файловая система, пути, права доступа
🐧 взаимодействие с сервером по SSH
🐧 потоки данных, пайплайны
🐧 синтаксис Bash: переменные, условия, циклы и скрипты
🐧 процессы, мониторинг, параллельные вычисления
🐧 работа с текстом, регулярки, nano, vim
🐧 виртуальные окружения, tmux

🚢 Билеты в круиз: agency.blastim.ru/expresslinux

Приятный бонус: если после мини-интенсива вы решите продолжить обучение и зарегистрируетесь на большой курс «Анализ NGS-данных», вы получите дополнительную скидку в размере стоимости интенсива (4 900 руб.)

Читать полностью…

🔈 Бесплатные занятия по NGS

До старта нашего флагманского курса «Анализ NGS-данных» осталось 2 недели, и мы открываем подготовительные уроки для всех желающих!

Эти материалы смело можно отнести к мастхэв современной науки, особенно если вы работаете с генетическими данными или интересуетесь биоинформатикой. Минимум академической пыли, максимум того, что пригодится на практике:

• познакомитесь с QC и критериями, которые помогут быстро понять, стоит ли продолжать работу с ДНК или библиотекой

• заглянете в мир Oxford Nanopore

• освежите знания или освоите основы Python и R, без которых анализ данных становится все менее удобным

• получите задания, чтобы не просто посмотреть видео, а сразу проверить, что удалось усвоить

Для доступа нужно зарегистрироваться в личном кабинете: https://agency.blastim.ru

Увидимся завтра 🥰

Читать полностью…

🍬 Голая правда про управление качеством в клинтриалс

RBQM, CtQ, QTL, KPI, KQI и ALCOA+ — для одних страшный набор букв, а для других — работа, от которой зависит, дойдет ли новый препарат до пациентов.

Сегодня в прямом эфире Михаил Камха, преподаватель Передовой инженерной школы МГУ, честно расскажет, как обстоят дела с организацией клинических исследований в российских центрах: что работает, где слабые места и почему привычные подходы нужно менять. А заодно объяснит, какая магия скрывается за сложными терминами и почему без них современная фарма уже не обходится.

Начинаем уже в 13:00 мск

Каждый зарегистрировавшийся участник получит гайд «20 красных флагов исследовательского центра» от спикера

🤖 Быстрая запись в боте: /channel/fbbmsu_bot
🔗 Или на сайте: https://agency.blastim.ru/qms

Читать полностью…

Индустрия дизайна детей в 2026 году

🗓 Вторник, 25 августа, 20:00 МСК
🎤 Марина Уткина

Пока общество спорит, допустимы ли такие технологии с этической точки зрения, услуга уже продаётся. Несколько американских компаний предлагают парам, проходящим ЭКО, ранжировать эмбрионы не только по риску наследственных заболеваний, но и по прогнозируемому интеллекту, росту и продолжительности жизни.

На лекции разберём:

• полигенный отбор эмбрионов и его реальные возможности;
• генетику интеллекта и ограничения генетических прогнозов;
• редактирование генома человека;
• ПГТ-А, ПГТ-М и ПГТ-P: чем медицинское тестирование отличается от отбора по желаемым признакам;
• компании, уже продающие подобные услуги: их продукты, цены и инвесторы;
• получение яйцеклеток и сперматозоидов из стволовых клеток и то, как эта технология может изменить репродукцию;
• регулирование технологии в США и Великобритании;
• происхождение используемых клеток, законодательные ограничения и реальную стоимость процедур.

Главный вопрос лекции: где заканчивается доказательная медицина и начинается индустрия обещаний?

🔗 Подключайтесь по ссылке

Читать полностью…

🥹 И от бабушки ушел, и от дедушки ушел, а от нас не уйдет. Кто? Хроматин

ChIP-seq, ATAC-seq, MNase-seq, DNase-seq — методы изучения хроматина: какие участки ДНК открыты, где сидят белки, как уложены нуклеосомы. У каждого своя логика и свой характерный след в данных. Именно поэтому одна и та же подозрительная картина в одном эксперименте знаменует фиаско, а в другом — ровно то, что вы могли искать.

Сегодня в 19:00 мск Александра Галицына расскажет, как отличить шум от настоящего сигнала и на что обращать внимание при контроле качества.

🔗 Моментальная регистрация в боте: /channel/BlastimWeb_bot

⚠️ Записи вебинара не будет — ждем онлайн

Читать полностью…

💊 Лучшее в организации клинических исследований — враг хорошего или необходимость?

Современный фармацевтический рынок предъявляет к исследовательским центрам новые требования: на первый план выходят понятность процессов и системное управление. Но так ли нужны изменения уже в привычной практике и как перейти к актуальным моделям организации? Об этом нам рассказал Михаил Кахма, преподаватель Передовой инженерной школы МГУ на базе ФББ МГУ:

Уважаемые коллеги, давайте честно взглянем на то, как исторически складывалась практика клинических исследований в наших медицинских организациях и в нашей стране. Долгое время исследования приходили в клинику благодаря личному авторитету главных исследователей, их профессиональным связям или стратегическим целям — например, включению препарата в перечень ЖНВЛП или клинические рекомендации.

И мы должны признать: на определенном этапе эта модель работала. Однако парадигма глобального фармацевтического рынка необратимо изменилась. Сегодня, в эпоху внедрения ICH E6(R3), спонсоры и международные CRO перестали оценивать центр исключительно по именам в штатном расписании. Их главный запрос — операционная зрелость и предсказуемость. Если ранее качество данных часто оставалось на откуп личной ответственности врача-исследователя, то современный стандарт требует иного. GCP больше не может существовать изолированно. Это часть сложной матрицы, включающей риск-ориентированное управление качеством (RBQM), валидацию компьютеризированных систем по GAMP5 и строгое соблюдение принципов ALCOA+.

Моя задача как преподавателя и практика — не критиковать прошлый опыт, а дать инструменты для будущего. На нашем курсе мы разбираем, как трансформировать исторически сложившуюся практику в отлаженную интегрированную систему управления качеством — систему, которая защитит репутацию вашей клиники, обеспечит безупречное прохождение аудитов и сделает ваш центр магнитом для серьезных исследовательских проектов.

🔗 А если вы впервые слышите о программе ДПО по направлению «Менеджмент» от ФББ МГУ, который упоминает Михаил, — самое время познакомиться с ней поближе: https://agency.blastim.ru/qms

Читать полностью…

Генетика предполагает, эпигенетика располагает, а NGS помогает всё это увидеть 🧬

На первый взгляд, начальный этап пайплайна анализа NGS максимально однообразен: получаем риды, базово смотрим качество, картируем на референс. Что может пойти не так? На самом деле очень многое зависит от дизайна исследования. Например, где-то мы хотим равномерное покрытие, а где-то, наоборот, стремимся к ярким пикам. В одном случае мы должны бить в набат, увидев высокий процент дубликатов, а в ином — такой результат ожидаем. Что для определенного протокола может быть важным биологическим сигналом, для другого — признаком жутких технических проблем. Хороший биоинформатик обязан ориентироваться в этой теме как рыба в воде.

20 августа на вебинаре мы научимся читать NGS-данные и использовать разные характеристики ридов для интерпретации эксперимента. Разбираться будем на примере разных «секов» для изучения эпигенома, таких как ChIP-seq, ATAC-seq, MNase-seq, DNase-seq. Бластим пригласил спикера с невероятно богатым опытом в этой области, Александру Галицыну (ФББ, Сколтех, MIT). Не пропустите!

Адженда:
➜ Всегда ли нестандартный QC-профиль это плохо?
➜ Чем отличается работа с одним ридом и с парой?
➜ Почему картирование дает отнюдь не только координату в геноме?
➜ Какие показатели почти всегда указывают на артефакты, а когда нужно учесть метод?
➜ Как перейти от сырых данных к осмысленным выводам?

Кому пригодится: всем новичкам в бионфе, специалистам, интересующимся эпигенетикой и логикой контроля качества

Регистрация по ссылке: /channel/BlastimWeb_bot
Если не работает, то тут: https://agency.blastim.ru/ngs#galitsyna

Читать полностью…