Голый землекоп

14 Oct 2024 15:45

Мы рассказывали об этом эксперименте с лисицами в эпизоде “Как человек стал самым жестоким и самым дружелюбным существом на планете”. Гость эпизода, биолог Брайн Хэйр, ездил в Новосибирск, изучал очередное поколение одомашненных лисиц, и установил, что в отличие от диких родственников, эти лисицы хорошо понимают указательный жест — а ведь это недоступно даже шимпанзе.

Брайан прислал нам короткое сообщение:

“Лисицы были страстью для доктора Трут – как и всё, что они могли нам рассказать о поведении, эволюции и генетике. Она была выдающимся учёным и матриархом своей невероятной команды, которую она вела в течение десятилетий, занимаясь разведением, уходом и изучением уникальной популяции лисиц. Конечно же, она очень ценила своих студентов, сотрудников и все открытия, которые они сделали – но по-настоящему огромная улыбка появлялась на ее лице, когда она рассказывала истории о лисицах, которых она вырастила и с которыми установила связь. Она любила лисиц, возможно даже больше, чем свою науку — и открытия, которые дало её страстное увлечение бесценны для всех нас”.

Голый землекоп

12 Oct 2024 19:46

Тот факт, что вы видите тут лицо, говорит о двух вещах. Первое: у вас в голове есть мозг, и он устроен довольно сложно. Компьютеры, которые замечательно отличают вас от других людей (при фото ID) - совершенно не видят тут лиц.

Умение распознавать лица мгновенно было критично для выживания, поэтому наши собственные нейросети очень чувствительны к этому образу. Настолько, что готовы иногда срабатывать зря: цена парейдолии, вот этих осечек -- невелика, зато уж когда в поле зрения будет настоящее лицо, они не ошибутся.

Наступила эра нейросетей, и ученые подумали: мб компьютеры уже стали настолько умны, что начнут ошибаться как люди? Группа исследователей (см прошл. сообщение) обучила нейросеть на большой выборке человеческих лиц. После чего они взяли подборку из 5000 картинок с разными пнями и пятнами от кофе, которую отобрали добровольцы: люди там видят лица. Нейросеть нашла "лица" лишь на 6% картинок.

И тогда - самое интересное: ученые добавили 22000 портретов животных в обучающую подборку. И вот тогда процент найденных среди пней и пятен кофе "лиц" увеличился в 2.5 раза.

Гипотеза авторов: нейросеть повторила эволюцию человека - люди начали видеть лица среди пней, потому что очень всматривались в поисках хищников. Не знаю, покупаете ли вы это объяснение, но кажется больше всего ученых радует сам факт этих иллюзий у ai: это говорит об очень высоком уровне развития и близости к мышлению как у человека.

Голый землекоп

11 Oct 2024 11:34

Помогите нам стать глобальнее! (см предыдущее сообщение)

Нас слушает очень много людей во всех странах Европы и США – так много, что где-то мы тесним Lex Fridman, а где-то -- RadioLab и ScienceVS.

Голый землекоп

11 Oct 2024 09:23

Фраза "всё связано со всём" часто звучит в нашем подкасте - это цитата из одного моего знакомого пятилетнего мальчика.

Я был очень рад, когда участница на одной из офф-лайн встреч появилась вот в майке! будем считать что это мерч с открытым кодом - просто сделайте такую, и чувствуйте себя членом нашего сообщества!

Голый землекоп

10 Oct 2024 18:44

Премия по физике 2024: за нейросети

(продолжение, начало тут )

Эта история начинается, как всё хорошее в этом мире, тоже с биологии. А именно с наблюдения, которое сделал биолог Рамон-и-Кахаль больше ста лет назад. Он резал мозг разных животных и людей на тонкие слои, научился прокрашивать их серебром, и установил, что нейроны образуют связи между собой. И вот он увидел, что именно в тех участках мозга, к которым сходится информация от всего тела, у разных животных возникают слоистые структуры: нейроны уложены слоями. Например у человека в больших полушариях мозга -- пять слоев.

Я написал для вас небольшую новеллу о том, что такое нейросети - это чтение на пять минут.

➡️➡️НОВЕЛЛА ПРО НЕЙРОСЕТИ


Лауреаты этого года -- двое физиков, Джефри Хинтон и Джон Хопфилд. Они занимались первыми компьютерными нейросетями – и в процессе увидели, что у них получается что-то, что больше похоже на физические, а не биологические объекты. В этот момент они задействовали математику, то есть уравнения, которые до этого использовались в физике для описания того, как ведут себя микроскопические частицы (например, электроны внутри магнита или молекулы в газе). Эти уравнения помогли им решать возникающие задачи -- и вот поэтому премию дали по физике, к возмущению многих комментаторов.

Итог - “совершенно новый способ использовать компьютеры” как сказал Нобелевский комитет. Компьютеры, которые работают способом, похожим на человеческий мозг, и способные к обучению. Хинтон ушел из Гугла, чтобы иметь возможность открыто обсуждать его мрачные опасения по поводу наступающей эры ai: “У нас нет опыта жизни рядом с чем-то, что умнее нас”, сказал он в интервью NYT.

Как я говорил, лично для меня одно из самых выдающихся достижений нейросетей -- возможность точно выяснять как устроены белки. Давайте вернемся к ним и обсудим последнюю премию - в следующем сообщении.

Голый землекоп

10 Oct 2024 16:34

Три нобелевские премии 2024: всё связано со всём

За первые три дня этой недели нобелевский комитет раздал премии ученым, и все они связаны с самой главной и любимой на этом канале наукой, биологией. Мне очень нравится такой итог нобелевского сезона 2024!

Во вторник присудили премию физикам, за вклад в создание нейросетей – и кстати, откуда это слово? из нейронауки же! Конечно, у нейросетей есть миллион применений – скажут мне, – но самая важная и сложная научная задача, которую они помогли решить – скажу я в ответ, – связана с биологией! В среду – премию по химии: ученым, которые применили нейросети к той самой важной и сложной задаче в биологии, ниже я расскажу как. А понедельник премию по физиологии или медицине присудили биологам, и их работа касается той же главной темы в биологии. Я очень надеюсь что вечером в пятницу вы обсудите с друзьями именно эту тему.

Итак вот эта главная тема: речь о том, как устроены белки, как они работают и как их работа создает всю сложность и разнообразие жизни на Земле. Чтобы оценить все эти выдающиеся исследования, нужно немного контекста. Это пять минут чтения, обещаю что будет не больно - по ссылке тут:

➡️➡️НЕМНОГО КОНТЕКСТА

А в следующих сообщениях я расскажу чуть подробнее о каждой из премий.

Голый землекоп

06 Sep 2024 20:12

Оказывается вчера был Международный День Орхидей. Поскольку это моя пожизненная страсть, я решил что это повод закончить летний перерыв и вернуться к постоянному вещанию. По этому случаю я хочу на сутки дать в чате нашего канала разрешение постить картинки: покажите ваши орхидеи? И расскажите о них.

Я хочу поделиться своей личной историей: о том как ровно 20 лет назад я нечаянно съел цветок одной орхидеи и что из этого вышло.


➡️➡️ ЧИТАТЬ ТУТ ⬅️⬅️


На фотографии — мексиканская Stahopea oculata из моей коллекции. Этот род очень ароматных орхидей привлекает самцов изумрудно-зеленых пчел из сем. Euglossini: насекомые натирают голени пахучим маслом из цветка и это делает их более привлекательными для самок. Редкий пример, когда орхидеи дают награду опылителям - подавляющее большинство из 30000 видов просто используют их для своих нужд и всегда изощренно обманывают, не давая взамен ничего.

Голый землекоп

11 Jul 2024 06:44

Мы очень благодарны нашим патронам - благодаря вам этот сезон стал возможен. Спасибо!

На картинке - моя попытка при помощи DALL-e рассказать о последнем бонусном выпуске в этом сезоне. В нем - два сюжета, которые не вошли в основной выпуск про Землекопа и Синенький Цветочек.

Если гигантские цепочки гиалуроновой кислоты тормозят воспаление - то короткие цепочки могут его усиливать. Наша гостья рассказала об удивительном курьезе: эпизоды короткой лихорадки у собак породы шарпей - и тут тоже не обошлось без гиаулуроновой кислоты. Второй сюжет прямо-таки философский: если в плотом киселе не развиваются опухоли, то как насчет эмбрионов? у эмбрионов землекопов есть свое решение этой проблемы - а ученые нашли невероятный обход для этой же задачи при выращивании оземлекопленных мышей.

Слушайте на Boosty и Patreon. И еще раз спасибо!

Голый землекоп

10 Jul 2024 14:58

.
Голый землекоп и синенький цветочек от рака: новый выпуск подкаста


Прошлой осенью мы писали (тут, тут, тут и тут) про эксперимент, в ходе которого ученые оземлекопили мышей: передали им один ген от африканских голых землекопов, и увидели замедление всех процессов старения -- ГМО мыши перестали умирать от рака и дряхлеть. На картинке - мои усилия вместе с DALL-E в попытке изобразить оземлекопленную мышь, в теле которой работают гигантские цепочки гиалуроновой кислоты.

В новом выпуске профессор Вера Горбунова (Рочестер, США) рассказывает о продолжении этого эксперимента весной 2024 года. После того, как робот провел скрининг 20000 веществ, нашлось неожиданное соединение, которое воспроизводит этот же эффект.

Возможно, нам самим не будет нужно становиться ГМО - чтобы стать немножко как голые землекопы. Будущее может выглядеть и так: люди просто начнут принимать вещества, угаданные машинным обучением -- и так тормозить старение. Слушайте новый выпуск на всех площадках, а также на Youtube и YouTube Music.

А еще, если вы в Тбилиси, приходите вечером в пятницу 12 июля на День Рождения студии ЛибоЛибо. Там будут все подкастеры студии, ну и я тоже.

Голый землекоп

26 Jun 2024 12:38

У нас вышел новый выпуск!

Слушать на всех платформах тут

На YouTube тут

Это выпуск для релаксации) Звуки науки: замечательные истории о научных открытиях, в которых особую роль играют звуки.

В конце выпуска - саунд арт, который помогает вам полностью пережить уникальное событие: в этом году впервые за 221 год совпали выходы на поверхность земли двух выводков периодических цикад, тринадцатилетних и семнадцатилетних. Чтобы вы могли прочувствовать чудесную игру простых чисел, современный художник Робин Мейер (ICRAM, Центр Помпиду, Франция) написал для нашего эпизода такой объект; вам будут нужны стереонаушники чтобы получить этот экспириенс.

В любом случае, слушайте с хорошим звуком: авторы открытия про имена слонов прислали специально для нашего выпуска звуки из своего эксперимента, и посоветовали, в свою очередь, провести эксперимент с нашими слушателями - сможет ли ваш мозг начать различать имена слонов не хуже, чем смогли научиться их нейросети.

Голый землекоп

07 Jun 2024 13:32

В последнем выпуске подкаста “Голый землекоп” ученые уже воскресили короткие пептиды, которыми неандертальцы побеждали бактериальные инфекции — и предлагают нам применить их, когда наши антибиотики перестанут работать (бесценный комментарий из инстаграм ЛибоЛибо: “я отказываюсь носить пептиды, которые уже носили до меня!”).

Станут ли неандертальские интерфероны брендом следующего сезона?

Голый землекоп

04 Jun 2024 12:26

Эта картинка сделала мой день: Гениорнис, чудовищный гусь из Австралии, который жил там 45000 лет назад, и который весил 230 кг.

Эти птицы известны больше ста лет - но никто не видел их череп. Поэтому было непонятно, чьи они родственники; самым естественным было считать, что это такие эму.

И вот, новая находка: полный череп (около 30 см длиной). В черепе полно деталей анатомии -- оказалось возможным полностью переопределить родственные связи: выяснилось, что это гигантский, разумеется нелетающий, гусь.

Самая непредсказуемая вещь - это прошлое.

Голый землекоп

29 May 2024 16:14

Во второй части этого эпизода уже совсем научная фантастика: гости этого сегмента воскрешают маленькие молекулы, которые когда-то циркулировали в организме неандертальца - и которые, по подсказке искусственного интеллекта стоит попробовать для нейтрализации устойчивых микробов. И тоже - эксперимент на мышах, в котором наступает момент истины: оказывается, что сразу несколько таких молекул имеют очень мощный потенциал.

Выясняется, что для решения наших проблем мы больше не ограничены разными видами плесени (как в случае с пеницилином) - и вообще не ограничены только теми организмами, которые сегодня живут на планете. Используя древнюю ДНК и искусственный интеллект, мы можем искать новые лекарства (или сорта пищевых растений, или материалы или что угодно) среди всех, кто когда-либо жил на планете.

Я напомню, что у нас был выпуск с нобелевским лауреатом Сванте Паабо, который первым придумал этот подход.

А еще хочу сообщить, что к новому выпуску у нас вышли два бонуса - с англоязычными интервью с нашими гостями. Спасибо нашим патронам!

Как обычно, эти выпуски можно слушать на моих ресурсах:

patreon.com/ilyakolmanovsky
https://boosty.to/zemlekop

А можно - на ресурсах студии ЛибоЛибо:

https://cutt.ly/pol0503tgktg - в специальном тг канале

https://cutt.ly/pol0503tgkap - эпп подкэстс

Голый землекоп

29 May 2024 13:33

Новый эпизод подкаста "Голый землекоп": хорошие новости про борьбу с бактериями


Слушайте новый эпизод, действие которого разворачивается в США -- и касается всех жителей нашей планеты (а тут - аудио на YouTube).

Я напомню: в одном из ранних эпизодов мы рассказывали о том, что антибиотики перестанут работать. Тогда мы с вами окунулись в воды рек Индии, где концентрация антибиотиков выше, чем в крови у пациентов, видели в Пакистане эпидемию нового тифа, и окунулись в кишечную флору владельцев собак в Португалии -- и всё время говорили о том, как резистентность надвигается на нас по всей планете.

В новом эпизоде мы с вами отправимся на линию фронта: посмотреть через плечо ученых, как именно и где они могут найти защиту от этой напасти.

Этот эпизод несет под единой оболочкой две довольно разные истории, и я расскажу о них по отдельности

ПРОДОЛЖЕНИЕ НИЖЕ

Голый землекоп

28 May 2024 14:09

Подкаст о театре "Закати сцену"

Остро чувствую себя самозванцем, но не могу удержаться: меня позвал в гости Михаил Калужский, автор подкаста о театре "Закати сцену" - и вышел неожиданно личный и откровенный разговор про поиски жанра. О том, почему мне так важны встречи офф-лайн. На фото - два моих любимых орудия производства, кликер и головной микрофон.

Spotify тут.

Голый землекоп

14 Oct 2024 15:43

Скончалась Людмила Трут (1933-2024)

Грустно, что мы не успели поговорить… Людмила Трут исследовала поведение лисиц в рамках легендарного эксперимента по одомашниванию, в ходе которого ученые отбирали зверей на терпимость и дружелюбие к человеку. Эксперимент был начат в Новосибирске академиком Д. К. Беляевым, длится уже больше 60ти лет, и продолжается сегодня.

Идея в том, чтобы ускорить эволюцию в тысячи раз, и увидеть как дикое животное превращается в “собаку”. При этом можно узнать, какие изменения происходят в мозге, в генах, в работе всего организма. Со временем оказалось, что некогда похожие изменения произошли и у человека -- нас тоже кто-то одомашнил. Книга Л. Трут в соавторстве с Ли Дугаткин вышла в США и стала бестселлером NYT (а позже вышло издание и на русском).

Я нашел ее интервью и фотографии в сети, вдруг вам интересно:

➡️➡️ ЧИТАТЬ ДАЛЬШЕ ⬅️⬅️


...

Голый землекоп

12 Oct 2024 19:35

Парейдолия: научить ai ошибаться как люди

Что вы видите на этих картинках? Они были использованы в исследовании американской группы ученых (MIT, NVIDIA, Microsoft, Toyota), которое было на днях представлено на конференции по компьютерному анализу изображений в Милане.

Ученые пытались научить ai ошибаться так, как ошибается мозг человека - они считают это умение бесценным.

Публикация предваряется цитатой из "Шекспира":

Гамлет

Вы видите вон то облако, почти что вроде верблюда?

Полоний

Ей-богу, оно действительно похоже на верблюда.

Гамлет

По-моему, оно похоже на ласточку.

Полоний

У него спина, как у ласточки.

Гамлет

Или как у кита?

Полоний

Совсем как у кита.


Я расскажу подробнее об этом через час на марафоне "Дождя", он посвящен попыткам этого телеканала выжить при помощи донатов, так что поддержите его тоже пож., если вы не в России.

Это история о том как жить, если мозг постоянно показывает нам то кино, которое считает нужным. Про это же будет мое новое интерактивное шоу, с которым мы появимся в этом году в Вильнюсе, Варшаве, Праге, Мюнхене, Марбелье, Лиссабоне и Амстердаме - далее везде.

Голый землекоп

11 Oct 2024 11:32

Всем привет, это Илья Колмановский, мы хотим сделать сезон “Голого Землекопа” на английском! и нам нужна ваша помощь!

Ужасно приятно писать в пресс-службу крупного университета, а в ответ получать сообщение на русском, что люди там знают и слушают наш подкаст. Ну и моё любимое – на пресс-конференциях слышать “Naked Mole Rat, please unmute your microphone”.

Недавно после моего первого англоязычного шоу в Лондоне ко мне подошел техник, и подписался на наш фид в Spotify: сказал что будет ждать появления англоязычных выпусков там. Ну и мы начали записывать лучшие эпизоды на английском языке, и я еще попрошу вас поделиться ими с вашими друзьями.

А пока просьба: мы, студия ЛибоЛибо, ищем партнера для англоязычной версии подкаста “Голый землекоп”. Это может быть любая компания (не в России) -- мы будем рады любому партнерству. Ниже англ. версия для копипаста -- мы будем очень признательны если вы нас с кем-то познакомите. В этом сезоне замечательные гости из разных университетов мира, которые рассказывают о китах и искусственном интеллекте, происхождении менструации, матриархате у слонов, природе агрессии у человека - и другие интересные вещи. Если есть идеи - напишите нам пож ksenia@libolibo.me

Ниже по-английски:

Dear friends, we are looking for a partner for an English adaptation of some of the most popular science podcasts: Naked Mole Rat. If you can think of anyone -- please introduce us.
Naked Mole Rat is an audio adventure into the world of scientific discovery, hosted by Ilya Kolmanovsky and attended by world top experts, Nobel prize winners, researchers and their subjects. Named after the bald, wrinkly and long-lived rodent from East Africa, this podcast turns biology into a forward-thinking journey, spotlighting the research that is shaping our future.
Rather than lecturing, Kolmanovsky becomes your immersive reporter—whether having his brain scanned at MIT while talking to GPT-chat or crawling through the Kenyan savanna to understand matriarchy among elephants. He brings listeners up close to science, making it tangible, relatable, and urgent.
What can bats teach us about surviving deadly viruses? How do whales hold the key to fighting cancer? And why are scientists studying foxes to learn more about human tendencies toward war and peace? In Naked Mole Rat, biology is about the here and now — a captivating show of ideas that makes the complex world of science come alive.
Please drop us a line if you have any thoughts! ksenia@libolibo.me

Голый землекоп

10 Oct 2024 19:47

Премия по физиологии или медицине 2024

(окончание, начало - тут)

Почему у кошки родятся только котята? и почему среди них нет двух одинаковых? Сегодня на оба вопроса даже ребенок знает ответ: дело в передаче по наследству генов. В генах записана вся информация обо всех белках, которые нужны чтобы с нуля сделать котенка, и эти гены несколько различаются у двух котят -- и соответственно различаются белки, которые работают в их органах и тканях.

А еще: жизнь котенка начинается с одной клетки. Клетки делятся пополам и еще пополам, и так много раз. При каждом делении все гены удваиваются, в каждой клетке котенка есть все его гены. Но как получается, что какие-то клетки образуют глаз, какие-то мозг, а какие-то – хвост? Понятно, что в разных клетках и органах должны работать разные белки. Но как регулируется этот процесс?

Именно в этой области сделали открытие два лауреата этого года, Виктор Эмброс и Джери Равкун. Это захватывающая история и я надеюсь написать о ней подробнее. Но для короткого сообщения, я хочу выделить одну философскую часть. МикроРНК, которую открыли эти ученые - это такая система тонко настроенных … выключателей (!) которые запрещают работу каких-то белков в конкретных клетках. Сначала эти выключатели нашли у одного червя, на котором они работали -- но мир встретил это открытие ледяным молчанием, потому что всем показалось, что это какой-то экзотический пример.

А в следующие годы микроРНК нашли почти у всех организмов на Земле, и ученым открылась поразительная картина. Судя по всему, вообще вся многоклеточная жизнь на этой планете стала возможной лишь потому, что появились эти выключатели, сотни миллионов лет назад. Только благодаря им можно настроить систему из большого количества клеток так, чтобы каждая выполняла свою работу. Ключевой инструмент – запрет на работу каких-то белков. И чем сложнее устроены животные, тем больше в их генах записано разных выключателей, микроРНК. У млекопитающих больше разных выключателей, чем у рыб, а у людей -- больше чем у всех других животных.

Это довольно дорогостоящая и не очень рациональная система, потому что дешевле и разумнее было бы регулировать при помощи ВКЛЮЧАТЕЛЕЙ, а не выключателей. На самом деле, включатели тоже есть, но живые системы всегда работают на балансе этих двух процессов. И да, это дороговато -- но эволюция работает на коленке, из палочек и веревочек, часто имея дело с нагромождением последствий прошлых не самых рациональных решений, и весь этот ворох тянется в череде поколений и очень зависит от выключателей.

Поскольку премия за медицину, в этом месте надо обязательно сказать, что ученые надеются разработать лекарства, которые работали бы на принципе этих же выключателей. Пока что самое главное для медицины: поломка этих самых “выключателей” часто приводит к раку, и это открытие поможет нам бороться с раком.

Голый землекоп

10 Oct 2024 17:38

Премия по химии 2024: за расчет структуры белков

(пожалуйста прочитайте предыдущее сообщение тут)

15 лет назад наступила эра нейросетей -- компьютерных алгоритмов с принципиально новыми возможностями для решения сложных задач. Тогда же Лондоне возникла компания Deep Mind, и ее научные лидеры, Джон Джампер и Демис Хассабис сегодня поделили между собой вторую половину премии по химии 2024 (про первую половину и Д. Бейкера я написал выше). Именно их нейросети сначала стали обыгрывать всех людей в го и в шахматы, но главное применение связано с биологией. Они решили, что расчет 3d структуры белков – самая важная задача для человечества, и создали нейросеть AlphaFold. Ее третья версия провела расчеты для всех белков человека, и для большинства известных белков всех организмов. Еще эта же нейросеть создает гигантскую базу о возможных поломках белков. Все это должно потянуть за собой революцию в медицине – и в большинстве наук о жизни в ближайшее время. Авторы выкладывают все результаты онлайн и ими пользуются все биологи мира.

Всё это стало возможным благодаря нейросетям, которые так сильно меняют нашу жизнь сегодня. Нейросети используются в самых разных науках и ученые давно ждали, когда дадут за них премию – и все гадали, в какой номинации. Когда вчера присудили двум физикам, все развели руками – ну причем тут физика? Об этом в следующем сообщении.

Голый землекоп

06 Sep 2024 20:27

Две встречи в Лондоне в следующее воскресенье 15.09, приходите! Обе - про открытия последнего года.

Билеты тут

В 16:00 - шоу на английском языке, для семей с детьми 9+ (на ваше усмотрение)

В 18:00 - стендап на русском языке, для взрослых (но можно взять с собой подростков)


Темы этих двух встреч пересекаются примерно на 25%. Как ученые надеются пообщаться с животными при помощи ai, почему голый землекоп не стареет (и сможем ли мы), что можно узнать из сгоревших рукописей, лекарства из давно вымерших существ - и еще много всего!) до встречи!

Голый землекоп

19 Jul 2024 17:06

Евгений Кисин великий, а эти вот работники "юстиции", которые сегодня объявили его "иноагентом" пусть горят в аду.

(А это эпизод, в котором Евгений помогает нам рассказать про рубато у кашалотов на примере Шопена)

Голый землекоп

10 Jul 2024 15:02

Неожиданный герой этого выпуска: дельфиниум, который выращивала на даче бабушка Веры Горбуновой. Только пожалуйста не ешьте эти цветки в попытке стать как землекопы: они смертельно ядовиты.

В любом случае, все достижения, которые мы описываем в новом выпуске - это превью будущего, а не руководство к действию сегодня: ученым предстоит найти еще более эффективные вещества, и провести клинические испытания.

Голый землекоп

27 Jun 2024 12:58

Если вам понравился новый эпизод про звуки науки, я хочу напомнить что несколько лет назад у нас был похожий выпуск - послушайте его тоже, и тоже лучше в наушниках

Голый землекоп

13 Jun 2024 08:47

У нас вышел новый выпуск. Пока в люди спорят о том, опасен ли искусственный интеллект, неожиданно сразу в нескольких странах ученые решили использовать нейросети для того, чтоб расшифровывать "язык" разных животных и устанавливать контакт с ними - а в будущем и с другими цивилизациями.

Как понять кита: выпуск о кашалотах и космосе

(тут - можно слушать на YouTube)

На картинке - тот самый Золотой Диск, который находится на борту Вояджера. Вы слышите эти записи после поминальника в конце выпуска.

Голый землекоп

07 Jun 2024 13:32

Самый древний насморк (и герпес, и бородавки на гениталиях)

Мы поставили еще один жестокий “эксперимент” с участием неандертальцев: заразили их тремя своими вирусами. Возможно, это их и добило окончательно. Вопрос в том, сможем ли мы извлечь из этого эксперимента пользу.

Это новое открытие, которое сделала группа ученых из Бразилии. Они НЕ поехали в Новосибирск, где хранится грудной позвонок и зуб неизвестного неандертальца, который умер 50000 лет назад в пещере Чагырская на Алтае.

Вместо этого, они скачали из облака данные обо всех фрагментах кода ДНК, которые когда-то извлекли из этих костей другие ученые. Всё, что они сделали — применили новый, более тонкий вид анализа. Они смогли впервые найти среди генов неандертальца кое-что неуловимое ранее: ДНК вирусов, которые его убили. Оказалось, что это вирусы сапиенса: аденовирус, вызывающий обычную простуду, вирус герпеса (тоже “простуда” - только на губе, а еще внезапные тяжелые случаи течения), вирус папилломы человека (ВПЧ, который вызывает бородавки на гениталиях и рак шейки матки).

ДНК бактерий раньше уже смывали с зубов неандертальца. Тогда же анализ показал, что это микроб сапиенса — и возможно он передался при поцелуях. Но бактерии гораздо крупнее, их геномы гораздо больше — а значит их проще прочитать даже в таких древних костях. Геномы вирусов маленькие и менее стабильные, они распадаются на более маленькие фрагменты, и до сегодня их не находили в такой древности.

Что за историю рассказывают нам эти новые находки? Я подозреваю, что тут две истории, одна интересная, и одна важная.

Интересная история вот какая: 70000 лет назад сапиенсы довольно плотно сидели в Восточной Африке, а неандертельцы занимали территорию от Сибири до Испании — а 50000 лет назад всё поменялось, сапиенсы вышли из Африки и неандертальцы быстро вымерли. Раньше считалось, что дело в том что мы — венец природы, а неандертальцы были глупыми. Но ХХй век принес новые находки и немножко сбавил градус ксенофобии в наших оценках. Стало ясно, что объем мозга у них часто был больше нашего, были ритуалы и сложная культура. В апрельском выпуске мы обсуждали с Ричардом Рэнгемом, что сила сапиенсов — в их сотрудничестве, дружелюбии к своим, и огромные группы как результат — и беспощадная агрессия к чужим.

С новым открытием, возможно, надо добавить в картинку еще и наши вирусы. Эволюция этих вирусов в крупных группах шла быстрее, и они быстро стали безобидными (до рака в те времена никто не доживал). А вот для неандертальцев встреча с этими вирусами могла оказаться смертельной, и может быть этот мор внес ключевой вклад в их вымирание.

Вообще, будет очень интересно переписать историю всех культур через призму вирусов, когда это станет возможным.

А вот что тут важно — важно для нас сегодня: получается, что 50000 лет назад мы провели глобальный эксперимент по заражению ДРУГИХ людей нашими вирусами. Сегодня к счастью мы так уже не делаем (примерно с 40х гг, когда тысячи людей были заражены гонореей в порядке эксперимента). Но может ли тот эксперимент принести нам пользу?

Гость второго сезона, нобелевский лауреат Сванте Паабо рассказывает в том выпуске, что неандертальский ген определил вдвое более тяжелое течение ковида, и это убило 200000 человек, которым не повезло оказаться потомками мезальянса каких-то сапиенсов и (пленных?) неандертальцев. Польза: изучая эти кейсы, мы можем узнать что-то важное о том, как убивает ковид, и так искать лечение особо тяжелых случаев.

Новое открытие: аденовирус, герпес, ВПЧ. Все три вируса так и остаются неизлечимыми — ни простуду, ни герпес мы не можем излечить лекарствами. ВПЧ тоже не можем, но хоть есть вакцина, которую мы даем детям до начала половой жизни. Что если наши методы станут настолько изощренными, что мы сможем хакнуть иммунную систему неандертальцев и узнать что-то новое о том, как бороться с этими вирусами?

Голый землекоп

04 Jun 2024 12:12

Привет! сегодня день объявлений про "Разное"🙏️️

Я очень горд, что меня позвали в культовый подкаст "Сперва роди", в котором несколько отцов уже много лет рассказывают о своей жизни с детьми. Это ужасно симптичные ребята, и если вы любите этот подкаст, то 9го июня в Риге будет оффлайн встреча с ними, не пропустите.

Сегодня - день рождения Алексея Навального. Его убили в России, но память о нем будет жива во всем мире. Сегодня в Берлине будет концерт в память об Алексее, я к сож. оказался в Вене и не попадаю, но если вы рядом - дойдите. А я буду в Берлине в субботу и в Праге в воскресенье, увидимся.

Мои друзья из Киева возобновили сбор денег на поддержку ПВО города. Почитайте про реальность жизни под российскими обстрелами в блоге "Настигло" научной журналистки Насти Травкиной -- и поддержите если можете.

И как всегда я хочу напомнить про инициативу "Assist Ukraine" -- сбор денег в поддержку ВСУ на востоке Украины и мирных жителей Харькова и харьковской области -- проект, в котором работает Ольга Шпак, которую вы помните по нашему выпуску "Киты и ракеты".

Голый землекоп

29 May 2024 16:08

Первая часть этого выпуска -- не про устойчивость, а про другое коварное свойство микробов: толерантность. Про способность пережить удар антибиотиком удивительным способом, который открыли в лабаоратории проф. Евгения Нудлера в NYU. Оказалось, что бактерии умеют придушить сами себя сероводородом - и так пережить кризис.

(я долго думал, а умеем ли мы так? отравить себя стрессом, депрессией -- снизить уровень метаболизма, замереть -- чтобы не обгореть в пламени тяжелых перемен?)

И тут машинное обучение дает рецепт: маленькую молекулу, которая уже существует, но про которую никто не думал как про усилитель антибиотика. Она вбивает клин в машину по производству сероводорода у микроба, и мы словно говорим микробу: дыши полной грудью, а мы будем тебя убивать антибиотиком.

И самое важное в таких работах: реальный эксперимент, где на мышах четко доказывается, что решение, которое нашел компьютер - действительно работает в реальной жизни.

Голый землекоп

28 May 2024 14:41

В этой связи - планы на неделю. Очень надеюсь повидать участников нашего сообщества.

Все детали - тут. До встречи!

Голый землекоп

16 May 2024 16:28

Насекомые вымирают

Один из апрельских номеров журнал Nature вышел с такой вот цикадкой на обложке, и пятью новыми исследованиями: что конкретно происходит с насекомыми, и отчего.

Одно исследование провела группа ученых из Великобритании, Германии и России: они выяснили, какие насекомые вымирают сейчас в первую очередь. Несколько лет назад эта же группа установила и доказала сам факт: за короткое время количество насекомых в Европе уменьшилось в четыре раза — просто по биомассе, если бы мы их всех взвесили на весах.

В новом исследовании они отмечают такой факт: общая биомасса упала, а число видов нет. Можно спросить себя: где в таком случае идет основная убыль? Оказалось, что первыми жертвами оказываются не редкие виды: среди них идут только колебания численности, то есть каких-то делается меньше, а других больше.

Основные же потери несут самые массовые виды. Они настолько массовые, что их называют инженерами экосистем: они опыляют растения. Следующим звеном будет вымирание растений и тех птиц и млекопитающих, которые едят эти растения.

Две другие статьи в этом же выпуске подробно рассказывают о вымирании пчел и шмелей, еще одна — о ключевой причине всего этого апокалипсиса. Анализ показывает, что это не вырубка и распашка, не загрязнение — ключевой фактор это изменение климата.

На планете происходит Шестое вымирание жизни. Пятое (65 млн лет назад) — прикончило динозавров, Четвертое (Пермь-Триассовое) было самым массовым и уничтожило вообще 90% всей жизни на суше. Но чего не было в те разы — это таких темпов, чтобы одно поколение могло бы наблюдать происходящее воочию.