انتشار مقاله‌ نوین و معرفی پایپ‌لاینی جدید به نام ToxIR

🧪 پایپ‌لاین ToxIR یک ابزار بیوانفورماتیکی پیشرفته مبتنی بر RNA-seq است که برای شناسایی، تحلیل و پروفایل‌کردن دقیق توکسین‌ها طراحی شده است. این پایپ‌لاین کاملاً مستقل از گونه‌ و بافت‌ بوده و قابلیت استفاده در طیف وسیعی از سیستم‌های زیستی، از باکتری‌ها و میکروارگانیسم‌ها تا یوکاریوت‌های پیچیده را با تنظیم کردن آن دارد.

🚀 پایپ‌لاین ToxIR با بهره‌گیری از فیلترهای چندلایه، تحلیل‌های توالی‌محور و ساختاری، و شناسایی الگوهای اختصاصی توکسینی، عملکردی به‌مراتب قوی‌تر از روش‌های پیشین و رویکردهای کلاسیک ارائه می‌دهد. این مزیت باعث کاهش چشمگیر false positive و افزایش دقت در شناسایی توکسین‌های شناخته‌شده و کشف توکسین‌های جدید می‌شود.

🔬 کاربردهای کلیدی ToxIR:

🧫 توکسین‌یابی در گونه‌ها و بافت‌های گوناگون
🦠 شناسایی توکسین‌های باکتریایی، جانوری و چندمنشأ
🧬 تحلیل ترنسکریپتوم‌های پیچیده
🧠 مطالعات تکاملی و مقایسه‌ای توکسین‌ها
💊 پشتیبانی از تحقیقات زیست‌پزشکی، ایمنی زیستی و کشف دارو

📢 نسخه‌ی Early Access این ابزار منتشر شده است و از طریق لینک زیر قابل دسترسی می‌باشد. نسخه‌ی نهایی و پایدار ToxIR، همراه با فایل‌های نهایی و مستندات کامل، به‌زودی منتشر خواهد شد.

🔗 دسترسی از طریق لینک زیر:
https://doi.org/10.1038/s41598-025-33632-0



✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Zarvaan

☀️ | @Zarvaan_Biotechnology

Читать полностью…

🧬🔥 ToxIR — A Universal RNA-seq Framework for Next-Generation Toxin Discovery


🧬 ToxIR (Toxin Identification and Recognition) is an advanced RNA-seq–based bioinformatics framework developed for accurate toxin identification, analysis, and transcriptome-level profiling. The pipeline is fully species- and tissue-agnostic, enabling applications across a broad spectrum of biological systems — from bacteria and microorganisms to complex eukaryotes.

⚙️ By integrating multi-layer filtering strategies, toxin-specific sequence and structural signatures, and robust transcriptomic analysis, ToxIR achieves substantially superior performance compared to traditional approaches. This results in reduced false positives and enables high-confidence discovery of both known and novel toxin candidates.

🔍 Key applications of ToxIR:

🧪 Toxin discovery across diverse species and tissue types
🦠 Identification of bacterial, animal, and multi-origin toxins
🧬 Analysis of complex transcriptomes
🧠 Evolutionary and comparative toxinology
💊 Support for biomedical research, biosafety, and drug discovery


📢 The Early Access version of ToxIR is now available and can be accessed via the link below. The finalized and fully documented release will be published soon.
🔗 Access via the link below:
https://doi.org/10.1038/s41598-025-33632-0



✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Zarvaan

☀️ | @Zarvaan_Biotechnology

Читать полностью…

Enjoy Piano 🎹✨

Name of the Piece: Hasood

Pianist: Echoes of the Forgotten Light

Music: Parviz Maghsadi

✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Zarvaan

☀️ | @Zarvaan_Biotechnology

Читать полностью…

If you don’t make a bold move, you will never be remembered.

– Mikhail Tal

✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Zarvaan

☀️ | @Zarvaan_Biotechnology

Читать полностью…

Innovative Projects at Zarvaan Biotechnology

At Zarvaan, we don’t just use tools—we create them.
This project is another major Projects of Zarvaan Biotechnology:
an advanced molecular docking platform with professional-grade capabilities, currently under development by our team.

✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Zarvaan

☀️ | @Zarvaan_Biotechnology

Читать полностью…

📢 ابزار جدید زروان بیوتکنولوژی؛ جعبه ابزار تحلیل توالی‌ها به صورت آفلاین: BioToolBox

تحلیل‌های اساسی زیست‌شناسی مولکولی و بیوانفورماتیک را به صورت آفلاین و بدون نیاز به پایتون انجام دهید! یک فایل EXE سبک و مستقل که در چند ثانیه آماده اجرا است.

🔬 ویژگی‌های کلیدی:

✅ یافتن ORF (شش قاب)؛ کاوش پروتئین‌های ترجمه‌شده به صورت تعاملی
✅ ابزارهای DNA؛ کامپلمانت و ریورس کامپلمانت
✅ وزن مولکولی، نقطه ایزوالکتریک، و پایداری پروتئین‌ها و ترکیب آمینواسیدها
✅ تراز جفتی توالی‌ها؛ پروتئین و نوکلئوتید، کاملاً تعاملی
✅ نقشه آنزیم‌های محدودکننده‌؛ خطی و دایره‌ای، نقاط برش قابل کلیک

💡 نیازی به نصب نیست. فقط اجرا کنید و تحلیل کنید.

💌 آماده‌اید شروع کنید؟ برای ما پیام بفرستید و همین امروز توالی‌های خود را تحلیل کنید!

© 2025 زروان بیوتکنولوژی. تمامی حقوق محفوظ است.

✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Zarvaan

☀️ | @Zarvaan_Biotechnology

Читать полностью…

🚀 Important Channel Announcement

From today, the main posts and scientific content of the channel will be published in English, while important notices and tool introductions will be provided in both English and Persian. This will help you become familiar with professional scientific language and gradually get used to it. Thank you for your continuous support!

✨ Stay tuned for amazing research opportunities, innovative products and tools, and advanced studies from us. 🚀


🚀 اطلاعیه مهم کانال

از امروز، پست‌های اصلی و محتوای علمی کانال به زبان انگلیسی منتشر می‌شوند و اطلاعیه‌ها و معرفی ابزارها نیز به‌صورت دو‌زبانه، انگلیسی و فارسی، قرار می‌گیرند. این کار همچنین باعث می‌شود شما با زبان تخصصی به شکلی شایسته آشنا شوید و به آن عادت کنید. ممنون از همراهی همیشگی شما!

✨ منتظر فرصت‌های پژوهشی شگفت‌انگیز، محصولات و ابزارهای نوآورانه، و تحقیقات پیشرفته ما باشید. 🚀

✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Zarvaan

☀️ | @Zarvaan_Biotechnology

Читать полностью…

🎉 تأسیس شرکت زروان زیست فناوری

با خوشحالی اعلام می‌کنیم زروان زیست فناوری رسماً ثبت شد و به زودی فعالیت‌های رسمی و پروژه‌های نوآورانه خود را آغاز خواهد کرد.
ما در مسیر توسعه و نوآوری در حوزه زیست‌فناوری، زیست‌شناسی محاسباتی، هوش مصنوعی و سایر حوزه‌های نوین هستیم و مشتاقیم دستاوردها و اخبار هیجان‌انگیز خود را با شما به اشتراک بگذاریم.

🤝 ما آماده همکاری با پژوهشگران، شرکت‌ها و علاقه‌مندان هستیم تا ایده‌ها و پروژه‌های نوآورانه را با هم پیش ببریم.

💡 زروان زیست فناوری — دانشی جاویدان، میراثی برای همیشه

📧 ایمیل:
zarvaanbiotechnology@gmail.com

لینکدین زروان زیست فناوری

✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Lumiparsis

☀️ | @Lumiparsis

Читать полностью…

هنوز سرکاریم و هنوز قدرتمند ... .
تیم ما براش خستگی معنایی نداره ... . حتی در ابزارهایی که ساخته‌ شده‌اند هم بسیار جای اصلاح و کار وجود دارد.
اگر میخوای جزئی از ما باشی بدون که قراره به دل حقیقت بزنی؛ اگر ذهن کنجکاوی داری و پر از شور یادگیری و علم هستی، جای تو پیش ماست. ولی ساده نیست؛ و قرار هم نبوده ساده باشه ... .

✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Lumiparsis

☀️ | @Lumiparsis

Читать полностью…

🧬✨ اپی‌ژنتیک‌تراپی: بازنویسی ژن‌ها برای درمان نسل جدید بیماری‌ها

🔹 اپی‌ژنتیک‌تراپی، یکی از نوآورانه‌ترین شاخه‌های پزشکی مدرن است که به جای تغییر توالی DNA، الگوهای اپی‌ژنتیکی سلول‌ها را هدف می‌گیرد. این روش‌ها امکان فعال یا خاموش کردن ژن‌ها را فراهم می‌کنند و مسیر درمان بسیاری از بیماری‌ها، از سرطان گرفته تا اختلالات عصبی و متابولیک، را متحول کرده‌اند. اپی‌ژنتیک شامل تغییراتی مانند متیلاسیون DNA، تغییرات هیستونی و RNAهای غیرکدکننده است که بیان ژن را بدون تغییر در توالی ژنوم تنظیم می‌کنند. در بیماری‌ها، اختلال در این مکانیسم‌ها می‌تواند منجر به خاموشی ژن‌های سرکوبگر تومور، فعال شدن ژن‌های سرطان‌زا، یا اختلال در توسعه مغز و بافت‌ها شود.

⚙️ تعدادی از مکانیسم‌های اپی‌ژنتیک‌تراپی

🧫 مهارکننده‌های DNA متیل‌ترانسفراز (DNMT inhibitors):

این داروها مانند Azacitidine و Decitabine مانع اضافه شدن گروه‌های متیل به DNA می‌شوند و ژن‌های خاموش‌شده را دوباره فعال می‌کنند. در سرطان‌هایی مانند لوسمی میلوئید حاد (AML) و میلودیسپلاستیک سندرم (MDS)، این داروها می‌توانند بیان ژن‌های سرکوبگر تومور را بازگردانند و مسیر رشد سلول‌های سرطانی را مهار کنند.

🧬 مهارکننده‌های هیستون د استیلاز (HDAC inhibitors):

این داروها با جلوگیری از حذف گروه‌های استیل روی هیستون‌ها، کروماتین را باز کرده و امکان رونویسی ژن‌ها را فراهم می‌کنند. داروهایی مانند Vorinostat و Romidepsin در درمان لنفوم‌های T-cell و برخی سرطان‌های دیگر مورد استفاده قرار گرفته‌اند.

💊 مهارکننده‌های کروماتین‌خوان (Bromodomain inhibitors):

این داروها پروتئین‌هایی که مارکرهای اپی‌ژنتیکی را می‌خوانند (reader proteins) هدف می‌گیرند و با تغییر ارتباط ژن‌ها و فاکتورهای رونویسی، بیان ژن‌ها را بازتنظیم می‌کنند. این روش به‌ویژه در درمان سرطان‌های مقاوم و بیماری‌های التهابی کاربرد دارد.

تکنیک‌های اپی‌ژنتیکی:

سیستم‌های CRISPR-dCas9 اپی‌ژنتیک و RNA های کوچک غیرکدکننده امکان هدف‌گیری دقیق پروموترها یا enhancerها را دارند. این ابزارها ژن‌های هدف را فعال یا سرکوب می‌کنند بدون آنکه توالی DNA تغییر کند، و بنابراین اثرات طولانی‌مدت و قابل بازگشت دارند.

🌍 اپی‌ژنتیک‌تراپی و آینده پزشکی دقیق

اپی‌ژنتیک‌تراپی تنها به عنوان یک درمان برای بیماری‌ها مطرح نیست؛ بلکه به پزشکی دقیق کمک می‌کند تا پاسخ فرد به داروها، پیشرفت بیماری و حتی پیشگیری از بروز بیماری‌های ژنتیکی و سرطان‌ها را پیش‌بینی و شخصی‌سازی کند. در ترکیب با فناوری‌های بیوانفورماتیک، مدل‌سازی سه‌بعدی ژنوم، و هوش مصنوعی، اپی‌ژنتیک‌تراپی امکان توسعه داروهای نسل بعد را فراهم می‌کند که نه تنها بیماری را درمان می‌کنند، بلکه مسیرهای سلولی و مولکولی را بازنویسی کرده و سلول‌ها را به وضعیت طبیعی بازمی‌گردانند.


✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Lumiparsis

☀️ | @Lumiparsis

Читать полностью…

🌌 خلق دنیای ناپیدا: شبیه‌سازی مولکولی بدون ساختار تجربی 🧬✨

در دنیای علم، همیشه همه‌چیز قابل دیدن نیست. بسیاری از مولکول‌ها هنوز در هیچ آزمایشگاهی ساخته نشده‌اند، یا تصویری تجربی از آن‌ها از طریق X-ray و NMR در دسترس نیست. اما علم امروز راهی پیدا کرده تا بدون نیاز به دیدن، بتوان آن‌ها را شناخت:
به دنیای شبیه‌سازی مولکولی پیش‌بینی‌کننده (Predictive Molecular Simulation) خوش آمدید؛ جایی که علم و محاسبه، جایگزین میکروسکوپ و آزمایشگاه می‌شوند ⚗️💡

🧩 شروع از صفر: طراحی ساختار اولیه

وقتی هیچ داده‌ی تجربی وجود ندارد، باید از پایه شروع کرد.
ساختار اولیه‌ی مولکول با توجه به فرمول شیمیایی یا ترکیب نظری آن طراحی می‌شود. در این مرحله از ابزارهایی مانند موارد زیر استفاده می‌شود:
✅️ از Avogadro برای طراحی هندسی اولیه،
✅️ از RDKit و Open Babel برای تولید ساختار از روی داده‌های شیمیایی،
✅️ و یا از الگوریتم‌های هوش مصنوعی برای پیش‌بینی ساختار سه‌بعدی

در این نقطه، تنها یک “طرح خام” از مولکول داریم که هنوز باید توسط قوانین فیزیکی تنظیم و تصحیح شود ⚙️

⚛️ بهینه‌سازی هندسی (Geometry Optimization)

در گام بعدی، ساختار اولیه به کمک محاسبات کوانتومی اصلاح می‌شود تا به حالت طبیعی و پایدار برسد. روش‌هایی مانند Density Functional Theory (DFT) یا مدل‌های Semi-Empirical برای کاهش انرژی کل سیستم و یافتن موقعیت دقیق اتم‌ها به کار می‌روند. نتیجه، ساختاری است که از نظر فیزیکی قابل‌پذیرش و از نظر انرژی، کمینه است؛ یعنی واقع‌بینانه‌ترین شکل ممکن از آن مولکول 💎

🔄 جستجوی حالت‌های پایدار (Conformer Search)

یک مولکول می‌تواند در فضا به هزاران شکل ممکن (Conformation) وجود داشته باشد.
در این مرحله، با استفاده از جستجوهای تصادفی یا الگوریتمی، همه‌ی حالت‌های ممکن بررسی شده و پایدارترین ساختارها انتخاب می‌شوند. این کار باعث می‌شود مولکول نهایی بیشترین شباهت را به حالت واقعی خود در محیط طبیعی داشته باشد 🧠

💧 قراردادن در محیط شبیه‌سازی‌شده

حال نوبت آن است که مولکول را در یک محیط واقعی‌تر قرار دهیم. برای این کار، معمولاً از یک جعبه حلال (Solvent Box) استفاده می‌شود که شامل مولکول‌های آب یا سایر حلال‌هاست. هدف، بررسی رفتار مولکول در شرایط نزدیک به واقعیت است؛ همان‌طور که در بدن یا محلول‌های آزمایشگاهی وجود دارد 🌊

🔥 داینامیک مولکولی (Molecular Dynamics Simulation)

اکنون زمان آن رسیده که مولکول “زنده” شود و حرکت کند! در شبیه‌سازی داینامیک مولکولی، نیروها و تعاملات میان اتم‌ها بر اساس قوانین نیوتن و میدان نیرو (Force Field) محاسبه می‌شوند. در هر گام زمانی (معمولاً در حد فمتوثانیه ⏱️)، موقعیت و سرعت هر اتم به‌روزرسانی می‌شود. نتیجه، یک فیلم واقعی از رقص اتم‌ها در طول زمان است 🎥✨
نرم‌افزارهای پرکاربرد در این مرحله عبارتند از:
✅️ GROMACS ⚡ برای سیستم‌های زیستی
✅️ LAMMPS 🔬 برای مواد و ساختارهای پیچیده
✅️ NAMD 💫 برای سیستم‌های بسیار بزرگ

📊 تحلیل نتایج و استخراج ویژگی‌ها

پس از پایان شبیه‌سازی، داده‌های عظیمی تولید می‌شود که باید تحلیل شوند. این داده‌ها می‌توانند شامل موارد زیر باشند:

✅️ انرژی‌های پتانسیل و جنبشی،
✅️ پایداری ساختار در زمان،
✅️ تغییرات زاویه‌ای و پیوندی،
✅️ بارهای الکترونی و رفتار الکترواستاتیکی،
✅️ و برهم‌کنش با مولکول‌های دیگر (مثل پروتئین‌ها یا DNA).

از طریق این تحلیل‌ها می‌توان پیش‌بینی کرد که مولکول چقدر پایدار است، در چه شرایطی فعال می‌شود، یا چگونه با مولکول‌های زیستی تعامل می‌کند 🧬

🚀 قدرت و کاربرد این روش

شبیه‌سازی مولکولی برای مولکول‌هایی که هنوز ساختار تجربی ندارند، به دانشمندان اجازه می‌دهد تا:
◀️ ساختارهای جدید را پیش‌بینی کنند،
◀️ پایداری آن‌ها را در شرایط مختلف بررسی نمایند،
◀️ مسیرهای واکنش را پیش‌بینی کنند،
◀️ و حتی داروهای جدید را طراحی کنند، بدون نیاز به آزمایشگاه پرهزینه 💊


✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Lumiparsis

☀️ | @Lumiparsis

Читать полностью…

I Forgive you ... .

✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Lumiparsis

☀️ | @Lumiparsis

Читать полностью…

با سلام ✋

🔴 با توجه به نیاز مهم دانشجویان تصمیم گرفتیم مجموعه‌ای از کانال‌های آموزشی رو به صورت #رایگان قرار دهیم، برای دسترسی به اون‌ها تنها یک کلیک کافیست!!

/channel/addlist/tBmtF7WX-R85ZDQx

Читать полностью…

⚙️ وقتی مولکول‌ها با قوانین کلاسیک حرکت می‌کنند: دنیای شگفت‌انگیز مکانیک مولکولی 🧬💫

در جهانی که اتم‌ها می‌لرزند و پیوندها می‌چرخند، قانونی نانوشته حکم‌فرماست:
مولکول‌ها هم از فیزیک تبعیت می‌کنند.
اینجاست که مکانیک مولکولی (Molecular Mechanics) وارد میدان می‌شود؛ علمی که بدون نیاز به مکانیک کوانتومی، می‌تواند ساختار و پایداری مولکول‌ها را در دنیای دیجیتال بازسازی کند.

🧠 ایده‌ی اصلی

در مکانیک مولکولی، هر اتم یک کره است و هر پیوند، یک فنر. وقتی پیوند کشیده یا فشرده می‌شود، انرژی تغییر می‌کند؛ درست مثل فنری که تحت فشار قرار می‌گیرد. هدف این است که ترکیبی از نیروها را طوری تنظیم کنیم تا مولکول به «پایدارترین حالت خود» برسد، یعنی جایی که انرژی کل سیستم کمینه است.

⚛️ فرمول جادویی انرژی در مکانیک مولکولی

E_total = E_bond + E_angle + E_torsion + E_vdw + E_electrostatic

📌 یعنی کل انرژی مولکول از پنج بخش ساخته می‌شود:
🔹 E_bond: انرژی کشش و فشردگی پیوندها
🔹 E_angle: انرژی تغییر زاویه بین پیوندها
🔹 E_torsion: انرژی چرخش زنجیره‌ها و پیوندهای آزاد
🔹 E_vdw: نیروی واندروالس (جاذبه‌های ضعیف بین اتم‌ها)
🔹 E_electrostatic: برهم‌کنش بارهای الکتریکی بین اتم‌ها

هرکدام از این نیروها مثل سیم‌های نامرئی‌اند که مولکول را در شکل واقعی‌اش نگه می‌دارند.

🧩 چرا مهم است؟

با مکانیک مولکولی می‌توان ساختار سه‌بعدی پروتئین‌ها، نانوذرات، پلیمرها و داروها را بدون هیچ آزمایشگاهی مدل کرد.
فقط با چند هزار معادله، می‌شود دید که مولکول‌ها در حالت پایدار چطور قرار می‌گیرند، کدام پیوندها قوی‌ترند، و کجا احتمال شکست وجود دارد.

🧪 نرم‌افزارهای کلیدی این جهان

AMBER | CHARMM | GROMOS | OPLS

هرکدام با مجموعه‌ای از «پارامترها» (force fields) تعریف می‌کنند که نیروها چطور عمل کنند.

🌌 خلاصه نکات

مکانیک مولکولی یعنی ترجمه‌ی قوانین فیزیک به زبان مولکول‌ها. در این جهان، پیوندها ارتعاش، چرخش، جذب و دافعه خودشان را دارند و در پایان، مولکول به آرامی در نقطه‌ای می‌ایستد که انرژی‌اش کمترین مقدار ممکن است: جایی میان نظم و هرج‌ومرج، تعادلِ زندگی برقرار می‌شود. ⚛️✨


✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Lumiparsis

☀️ | @Lumiparsis

Читать полностью…

From Dark Matter by Blake Crouch

I'm unaware that tonight is the end of all of this. The end of everything I know, everything i love.

✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Lumiparsis
#فرنود
☀️ | @Lumiparsis_english

Читать полностью…

انتشار مقاله‌ نوین و معرفی پایپ‌لاینی جدید به نام ToxIR

https://doi.org/10.1038/s41598-025-33632-0


✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Zarvaan

☀️ | @Zarvaan_Biotechnology

Читать полностью…

🧬✨ Hidden Truths in Genetic Diagnosis & Molecular Genetics: What Doctors & Pharmacists Often Overlook! 🔬💊

Genetic diagnosis and molecular genetics are revolutionizing medicine and pharmacy, but some crucial aspects remain overlooked. Here are 10 key factors that deserve more attention in clinical practice! 🚀

🔗 Epigenetics: The Missing Layer of Genetic Information

Most focus on DNA mutations 🧬 but forget epigenetic modifications—chemical markers that turn genes on/off 🛑⚡. Factors like diet 🥦, stress 😰, and toxins ☣️ can alter these marks, affecting disease development without changing DNA!

🧩 Non-Coding DNA: More Than Just “Junk”

Only 2% of DNA codes for proteins! The rest—once dismissed as "junk" 🗑️—contains regulatory elements, microRNAs, and long non-coding RNAs 🌀, which control gene expression and disease susceptibility in ways we barely understand.

🧬 Polygenic Risk Scores: Diseases Are Rarely Monogenic

Many conditions like diabetes 🍩, heart disease ❤️, and cancer 🦠 are polygenic—caused by multiple genes, not just a single mutation! Ignoring polygenic risk scores 📊 can lead to misdiagnosis or incomplete risk assessments.

💊 Pharmacogenomics: Why One Drug Doesn’t Fit All

People metabolize drugs differently 🏥! Genetic variants in enzymes like CYP450 🌀 affect drug effectiveness, causing either toxicity ☠️ or treatment failure 🚫. Yet, genetic-based drug dosing is still not standard practice!

🧩 Somatic vs. Germline Mutations: The Source Matters

Doctors often overlook the difference between:
🔹 Germline mutations (inherited 🏡, present in all cells)
🔹 Somatic mutations (acquired 🎯, found in specific tissues, like cancer)
Understanding this distinction is critical for cancer therapies 🎗️ and genetic counseling.

⚡ Mitochondrial DNA: The Forgotten Genome

Most focus on nuclear DNA 🧬, but mitochondrial DNA (mtDNA)⚡ controls energy metabolism 🔥 and is linked to neurodegenerative diseases 🧠, metabolic disorders 🏃‍♂️, and aging ⏳. Yet, it’s often ignored in genetic testing!

🦠 Microbiome & Host Genetics: The Unseen Interaction

Gut bacteria influence gene expression 🦠➡️🧬, drug metabolism 💊, and immune response 🛡️. Yet, few clinicians consider microbiome analysis alongside genetic testing when diagnosing autoimmune & metabolic diseases!

🔄 Alternative Splicing: One Gene, Multiple Proteins

A single gene can produce multiple proteins 🎭 through alternative splicing 🔄. Mutations affecting splicing can cause diseases, but standard genetic tests often fail to detect them!

🛠️ Structural Variants: More Than Just Point Mutations

Genetic tests focus on SNPs (single nucleotide changes) 🧩 but ignore larger variations—deletions ❌, insertions ➕, and copy number variations (CNVs) 🔢—which can have a massive impact on health.

🌍 Gene-Environment Interactions: The Silent Triggers

Having a risky gene variant doesn’t mean you’ll develop the disease! Environmental triggers like pollution 🌫️, diet 🥗, and infections 🦠 can turn genes on/off, influencing disease progression. Yet, this is rarely considered in clinical practice.

🚀 The Future of Genetic Medicine: A More Complete Approach! 🧬💡

To truly personalize medicine 🎯, doctors & pharmacists must integrate:

✅ Epigenetics 🔗
✅ Polygenic risk scores 📊
✅ Pharmacogenomics 💊
✅ Gene-environment interactions 🌍
✅ Microbiome research 🦠

By embracing these overlooked factors, we can create a revolution in diagnostics, treatment, and patient care! 🌟💙


✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Zarvaan

☀️ | @Zarvaan_Biotechnology

Читать полностью…

🎹 When Humans Were Still Deep: The Age of Geniuses Who Created Art and Science for Truth, Not the Market

In a time not long ago—an era when music and science still flowed from passion and love—humans created things that endured.
Not for sale.
Not for fame.
But to shout the truth.

Beethoven became deaf, yet he composed symphonies that shook the world. Chopin, in exile, wrote nocturnes that immortalized the ache of longing. Schubert, struggling with poverty and illness, composed melodies where every note felt like a lover’s last breath. Rachmaninoff, after depression, created concertos that exploded with human emotion.

They earned money to survive,
but creating was a necessity of their soul, not a business.
Their art was confession, wound, love—not a market product.

The same was true in science.
In an era when Darwin, Tesla, Planck, Einstein, Schrödinger, Boltzmann, and others redefined the world,
science was more than a profession—it was obsession, worship, the pain of understanding.
Money was only a means to survive;
it was never the reason to discover.

📉 Today…

Music is made to trend, not to move the human heart. Science is done to publish papers, not to uncover truth. Humans are trapped in KPIs and deadlines. Depth, pain, and love have faded.

✨ The difference is clear:
Back then, humans burned to create.
Today, humans create to sell.

And this is the difference between a masterpiece and a product.


✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Zarvaan

☀️ | @Zarvaan_Biotechnology

Читать полностью…

پروژه‌های نوآورانهٔ زروان زیست‌فناوری

اینجا ما فقط از ابزارها استفاده نمی‌کنیم؛ ما ابزار خلق می‌کنیم.
این پروژه نیز یکی دیگر از پروژه‌های بزرگ زروان زیست‌فناوری است:
ابزار داکینگ پیشرفته با قابلیت‌های فوق‌حرفه‌ای که تیم ما در حال توسعهٔ آن است.

در ادامه بخشی از کاربردهای ابزارهای داکینگ مولکولی آورده شده است:

⭐️ فهمیدن اینکه هر دارو دقیقاً به کدام بخش از پروتئین متصل می‌شود

⭐️ انتخاب بهترین دارو برای یک هدف پروتئینی خاص

⭐️ پیش‌بینی اینکه آیا یک جهش ژنتیکی باعث مقاومت دارویی می‌شود یا نه

 — کاربرد مهم در سرطان، بیماری‌های عفونی و فارماکوژنتیک

⭐️ کمک به انتخاب داروی مناسب در بیماری‌های پیچیده و چندعاملی

⭐️ شناسایی تداخل‌های ناخواستهٔ دارویی

⭐️ کمک به طراحی داروهای اختصاصی‌تر و کم‌عارضه‌تر

 — با افزایش قدرت اتصال و کاهش off-target effects

⭐️ استفادهٔ اورژانسی برای drug repurposing

 — بسیار کاربردی در شرایط بحرانی مانند بیماری‌های نوظهور

⭐️ کمک به پژوهش‌های پایه در زیست‌فناوری و پزشکی مولکولی

✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Zarvaan

☀️ | @Zarvaan_Biotechnology

Читать полностью…

داستان یک همراهی علمی

اوایل مسیر علمی‌ام بود؛ زمانی که هنوز تجربه جدی پژوهشی نداشتم و با تردیدهای معمول یک دانشجوی تازه‌کار که دوره‌های تخصصی را پشت سر گذاشته، دست‌وپنجه نرم می‌کردم. همان روزی که وارد دفتر دکتر نادری شدم، نمی‌دانستم قرار است نقطه آغاز یکی از مهم‌ترین تجربه‌های علمی زندگی‌ام رقم بخورد.

دکتر نادری با اعتماد کم‌نظیری داده‌های یک پروژه پیچیده را در اختیارم گذاشتند؛ اعتمادی که برای من فقط یک مسئولیت نبود، بلکه یک نیروی محرک شد. برخورد مهربانانه، انرژی مثبت و فضای امنی که ایشان ایجاد کردند باعث شد شب‌ها تا صبح روی پروژه کار کنم، نه از اجبار، بلکه از شوق. در کنار استاد، کاری را پیش بردیم که در ابتدا «نشدنی» به نظر می‌رسید، اما همان اعتماد، سختی مسیر را به انگیزه تبدیل کرد.

در پژوهش، داشتن استاد خوب فقط به دانش او مربوط نیست. استاد خوب کسی است که علاوه بر دانش، ذهن باز دارد، ایده‌های دانشجو را جدی می‌گیرد و مهم‌تر از همه به دانشجو یاد می‌دهد که محدودیت‌ها اغلب در ذهن ما هستند، نه در علم. من خوش‌شانس بودم که چنین تجربه‌ای را داشته باشم.

این همکاری به من آموخت که پژوهش واقعی، نتیجه یک رابطه دوطرفه است؛ دانشجو باید عطش یادگیری داشته باشد، و استاد باید آن فضا، حمایت و اعتماد را فراهم کند تا دانشجو بتواند از سطح توانایی‌های خود فراتر برود و مرزهای علم را بشکند. در این مسیر، من علاوه بر مهارت‌های علمی، یک درس عمیق گرفتم:
گاهی یک جمله از استاد می‌تواند انگیزه‌ای بیشتر از صد واحد درسی به دانشجو بدهد؛ جمله‌ای مثل «تو می‌تونی».

امیدوارم در ادامه مسیر علمی‌ام، دستاوردهایی به دست بیاورم که شایسته این اعتماد و همراهی باشد. و در نهایت، اگر شما هم در مسیر خود استادی دارید که چنین تأثیری بر زندگی علمی‌تان گذاشته، قدر حضور و زحمات او را بدانید.

در پایان، از دکتر نادری سورکی بابت تمامی حمایت‌ها، راهنمایی‌ها و اعتمادی که از روز اول به من داشتند، صمیمانه سپاسگزارم.

#پیام_مدیریت

✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Zarvaan

☀️ | @Zarvaan_Biotechnology

Читать полностью…

📢 BioToolBox – Your Offline Sequence Analysis Suite

Perform essential molecular biology and bioinformatics analyses offline — no Python needed! A lightweight, standalone EXE, ready in seconds. Developed by Zarvaan Biotechnology.

🔬 Key Features:

✅ ORF Finder (6-Frame) – explore translated proteins interactively
✅ DNA Utilities – complement & reverse complement
✅ ProtParam – molecular weight, pI, stability, amino acid composition
✅ Pairwise Alignment – protein & nucleotide, fully interactive
✅ Restriction Map – linear & circular, clickable cut-sites

💡 No installation required. Just run and analyze.

💌 Ready to get started? Message us and start analyzing your sequences today!

© 2025 Zarvaan Biotechnology. All rights reserved.

✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Zarvaan

☀️ | @Zarvaan_Biotechnology

Читать полностью…

بجنب ... .
زمانت توی این جهان خیلی زودتر از چیزی که فکر می‌کنی تموم میشه.
نه آنتروپی بهت فرصت میده نه کوانتوم ... .
الان انجامش بده.
نذار حسرتش بمونه.
فردا دیره ... .
بجنب! و بگذار لحظه‌های باقی‌مونده‌ت واقعاً زندگی بشن ... .
گاهی آدم‌ها درست وقتی متوجه می‌شن که خیلی دیر شده ...
منتظر چی هستی؟


✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Zarvaan

☀️ | @Zarvaan_Biotechnology

Читать полностью…

وقتی رفیقم مرزهای بیلیارد رو جابه‌جا میکنه 😂😂

#نیما

✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Lumiparsis

☀️ | @Lumiparsis

Читать полностью…

نابغه‌ها و دیوانه‌ها یک وجه مشترک دارند و آن هم این است که هر دو در دنیایی غیر از دنیای دیگران زندگی میکنند ... .

✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Lumiparsis

☀️ | @Lumiparsis

Читать полностью…

فرصت همکاری علمی برای دانش‌آموزان دبیرستانی 🎓

دوست داری هم یاد بگیری هم تجربه علمی واقعی داشته باشی؟ تیم Lumiparsis دنبال دانش‌آموزای کنجکاو و خلاق می‌گرده تا بعد از آموزش و فعالیت در آکادمی، وارد پروژه‌های علمی واقعی بشن و مسیر خلق دانشمندان جوان رو با هم بسازیم! 🧬📝

💡 مزایا:

✅ یادگیری علوم زیستی، علوم پزشکی و حوزه‌های مرتبط در پژوهش‌های واقعی

✅ آشنایی با مقالات و علوم روز دنیا

✅ تجربه نوشتن علمی و کار تیمی

✅ فرصت خلق پروژه‌های الهام‌بخش و علمی

📩 برای همکاری و اطلاعات بیشتر، فقط کافیه به روابط عمومی لومی‌پارسیس پیام بدی!

لینک روابط عمومی لومی‌پارسیس



✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Lumiparsis
#فراخوان

☀️ | @lumiparsis

Читать полностью…

بااحترام به
  دوستانی که گزینه بله رو انتخاب کردن لینک کانال ها رو در زیر قرار میدم👇🌹🌹

/channel/addlist/88IS8uPpvJ42ODA0

/channel/addlist/ID7JevNCPaM3OTA8

Читать полностью…

⚛️ جنگ فرمت‌ها در دنیای ساختار مولکولی 💥

🧬 از PDB تا mmCIF؛ کدام فرمت قوی‌تر، دقیق‌تر و آینده‌دارتر است؟
در زیست‌شناسی ساختاری و شیمی محاسباتی، داده‌های مولکولی در قالب فایل‌هایی ذخیره می‌شوند که اطلاعاتی از اتم‌ها، پیوندها، زوایا، و مختصات سه‌بعدی را شامل می‌شود.

هر فرمت اهداف و قدرت خاص خودش را دارد؛ بعضی سبک و ساده‌اند، بعضی علمی و دقیق، و بعضی هم مخصوص تحلیل‌های محاسباتی سنگین‌اند. 💪

🧩 PDB (.pdb)

🔹 قدیمی‌ترین و شناخته‌شده‌ترین فرمت زیستی جهان
🔹 توسعه یافته در دهه ۱۹۷۰ توسط Protein Data Bank
📄 ویژگی‌ها:
✅️ متن ساده و قابل‌خواندن به صورت دستی (plain text)
✅️ ساختار خط‌به‌خط با رکوردهای ثابت مثل ATOM، HETATM، CONECT
✅️ هر اتم با مختصات X, Y, Z و اطلاعات زنجیره توصیف می‌شود
⚠️ محدودیت‌ها:
⛔️ طول ستون‌ها محدود است (نهایتاً 80 کاراکتر در هر خط)
⛔️ مشکل در ساختارهای بزرگ با بیش از ۹۹٬۹۹۹ اتم
⛔️ داده‌های متا (مثل جهش‌ها یا ترکیب‌های پیچیده) به‌سختی ذخیره می‌شوند
💬 نتیجه:
📉 فرمت کلاسیک و محبوب، اما برای داده‌های جدید دیگر کافی نیست.

🧠 mmCIF (.cif / .mmCIF)

🔹 مخفف Macromolecular Crystallographic Information File
🔹 توسعه داده شده برای جایگزینی کامل PDB
🌟 ویژگی‌ها:
✅️ ساختار جدولی و سازمان‌یافته‌تر (نه ستونی)
✅️ پشتیبانی از داده‌های بسیار بزرگ (تا میلیون‌ها اتم)
✅️ مناسب برای برنامه‌نویسی و پردازش خودکار
✅️ دارای متادیتاهای دقیق درباره‌ی روش‌های تجربی، وضوح ساختار و زنجیره‌ها
⚙️ کاربرد:
◀️ فرمت رسمی حال حاضر در RCSB PDB
◀️ مورد استفاده در نرم‌افزارهای مدرن مثل ChimeraX, Biopython, PyMOL (جدید)
💬 نتیجه:
✅ پیشرفته‌ترین و استانداردترین فرمت فعلی برای ساختارهای زیستی بزرگ.

💧MOL (.mol)

🔹 فرمت مخصوص شیمی مولکولی (نه زیستی)
🔹 توسعه‌یافته توسط MDL (Molecular Design Limited)
📄 ویژگی‌ها:
✅️ شامل اطلاعات دقیق اتم‌ها و پیوندها (Bond Orders, Coordinates)
✅️ در محاسبات شیمیایی و طراحی دارو استفاده می‌شود
✅️ بسیار سازگار با نرم‌افزارهای شیمی محاسباتی مثل ChemDraw, Avogadro, RDKit
💬 نتیجه:
🧪 فرمت سبک، دقیق و مناسب برای مولکول‌های کوچک (ligands, metabolites, drugs).

🔬 SDF (.sdf)

🔹 نسخه‌ی پیشرفته‌تر MOL برای چند مولکول در یک فایل
📄 ویژگی‌ها:
✅️ هر مولکول با بلاک جدا تعریف می‌شود
✅️ شامل ویژگی‌های شیمیایی، نام، شناسه، بارها، و خصوصیات فیزیکی است
✅️ بسیار محبوب در بانک‌های ترکیبات دارویی (PubChem, ChEMBL)
⚙️ نتیجه:
📚 بهترین انتخاب برای ذخیره‌ی مجموعه‌ای از مولکول‌ها با ویژگی‌ها و متادیتا

🌌 XYZ (.xyz)

🔹 فرمت بسیار ساده برای ذخیره مختصات سه‌بعدی
📄 ساختار:
3
Water molecule
O 0.000 0.000 0.000
H 0.758 0.584 0.000
H -0.758 0.584 0.000
ویژگی‌ها:
✅️ فقط شامل نام اتم و مختصات (بدون اطلاعات پیوندی)
✅️ مناسب برای نمایش سریع یا ورودی به شبیه‌سازی‌های محاسباتی
💬 نتیجه:
📉 سبک و سریع ولی فاقد اطلاعات شیمیایی؛ بیشتر برای ورودی نرم‌افزارهای دینامیک مولکولی استفاده می‌شود.

⚡ PDBQT (.pdbqt)

🔹 نسخه‌ی اصلاح‌شده‌ی PDB برای نرم‌افزار AutoDock / Vina
ویژگی‌ها:
✅️ شامل بارهای جزئی (partial charges)
✅️ شامل نوع اتم (AutoDock atom type)
✅️ امکان تعریف چرخش‌های آزاد (torsions)
💬 نتیجه:
🎯 اختصاصی برای Docking و مدل‌سازی برهم‌کنش دارو-پروتئین

🧬 GRO (.gro)

🔹 فرمت مخصوص GROMACS برای شبیه‌سازی دینامیک مولکولی
ویژگی‌ها:
✅️ داده‌های مختصات اتمی + اطلاعات مربوط به جعبه شبیه‌سازی
✅️ بسیار سریع و دقیق برای پردازش‌های محاسباتی
✅️ نه برای مشاهده، بلکه برای اجرای شبیه‌سازی کاربرد دارد

🧠 جمع‌بندی به سبک لومی‌پارسیس

🔹 اگر با پروتئین‌ها و ساختارهای زیستی کار می‌کنی؛ از mmCIF استفاده کن (استاندارد جهانی جدید).
🔹 اگر تمرکزت روی ترکیبات دارویی یا شیمیاییه؛ SDF بهترینه.
🔹 برای Docking؛ فقط PDBQT.
🔹 برای ورودی شبیه‌سازی؛ XYZ یا GRO عالی‌ان.
🔹 و اگر دنبال سادگی و سازگاری جهانی هستی؛ هنوز هم PDB پرکاربردترینه.


✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Lumiparsis

☀️ | @Lumiparsis

Читать полностью…

#پیام_مدیریت

سلام همراهان همیشگی لومی‌پارسیس! 🌟
امیدوارم حالتون خوب باشه و دل‌هاتون پر از شادی.

خیلی ممنونم از دوستانی که رزومه‌هاشون رو ارسال کردند. هنوز فرصت همکاری دارید، می‌تونید پیام یا رزومه خودتون رو به روابط عمومی ارسال کنید. بعد از بررسی، حتماً به افراد پذیرش شده اطلاع داده میشه و کسانی که هنوز پذیرش نشدن، به محض شروع پروژه‌های جدید، به تیم اضافه خواهند شد.

یه نکته جالب هم می‌خوام باهاتون در میون بذارم: وقتی چنل‌های شما رو می‌بینم واقعاً لذت می‌برم! خیلی از شما چنل‌های علمی، تجربه شخصی یا هنری جذاب دارید، اما دنبال‌کننده‌هاش زیاد نیست.

برای همین، می‌خوایم به شما فرصت بدیم چنل‌تون رو به صورت رایگان پروموت کنید. فقط کافیه پیام بدید به اکانت روابط عمومی همراه با معرفی خودتون و چنلتون. متن‌های خوبتون بررسی میشه و در چنل رسمی ما فوروارد خواهد شد.
اینطوری هم چنل شما دیده میشه، هم جامعه علمی و هنری قوی‌تری می‌سازیم. 💡

- مهران

✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Lumiparsis

☀️ | @Lumiparsis

Читать полностью…

🎵 پژواکی دیگر از نور فراموش‌شده

نام موسیقی: گرَک🎹✨
نوازنده و آهنگساز: پژواک‌های نور فراموش‌شده

Name of the Piece: GRACK 🎹✨
Composer and pianist: Echoes of the Forgotten Light

می‌تونید احساس خودتون رو درباره این قطعه با ما به اشتراک بگذارید ... .

✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Lumiparsis

☀️ | @Lumiparsis

Читать полностью…

وصیت‌نامه گابریل گارسیا مارکز

🎧 در این دکلمه، یکی از بزرگ‌ترین نویسندگان جهان ( نویسنده کتاب صد سال تنهایی ) از تمام چیزهایی می‌گوید که در زندگی فهمید؛ از عشق، پشیمانی و لحظه‌هایی که دیگر برنمی‌گردند.
با صدای ماندگار نصرالله مدقالچی، این وصیت‌نامه تبدیل شده به سفری عمیق در معنای واقعی زندگی. 🌅

✉️ Contact our Public Relations team:
📩 Public Relations

#Lumiparsis

☀️ | @Lumiparsis

Читать полностью…